Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Fndc1E9Q043 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Fndc1E9Q043 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Fndc1E9Q043 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Fndc1E9Q043 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Fndc1E9Q043 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Fndc1E9Q043 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Fndc1E9Q043 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Fndc1E9Q043 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Fndc1E9Q043 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Fndc1E9Q043 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Fndc1E9Q043 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
Fndc1E9Q043 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Fndc1E9Q043 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Fndc1E9Q043 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Fndc1E9Q043 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Fndc1E9Q043 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Fndc1E9Q043 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Fndc1E9Q043 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Fndc1E9Q043 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Fndc1E9Q043 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Fndc1E9Q043 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Fndc1E9Q043 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Fndc1E9Q043 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Fndc1E9Q043 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Fndc1E9Q043 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Fndc1E9Q043 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Fndc1E9Q043 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Fndc1E9Q043 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Fndc1E9Q043 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Fndc1E9Q043 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Fndc1E9Q043 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Fndc1E9Q043 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Fndc1E9Q043 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Fndc1E9Q043 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Fndc1E9Q043 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Fndc1E9Q043 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Fndc1E9Q043 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Fndc1E9Q043 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Fndc1E9Q043 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Fndc1E9Q043 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Fndc1E9Q043 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Fndc1E9Q043 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Fndc1E9Q043 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Fndc1E9Q043 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Fndc1E9Q043 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Fndc1E9Q043 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Fndc1E9Q043 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Fndc1E9Q043 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Fndc1E9Q043 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Fndc1E9Q043 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Fndc1E9Q043 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Fndc1E9Q043 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Fndc1E9Q043 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Fndc1E9Q043 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Fndc1E9Q043 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Fndc1E9Q043 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Fndc1E9Q043 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Fndc1E9Q043 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Fndc1E9Q043 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Fndc1E9Q043 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Fndc1E9Q043 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Fndc1E9Q043 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Fndc1E9Q043 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Fndc1E9Q043 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Fndc1E9Q043 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Fndc1E9Q043 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
Fndc1E9Q043 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Fndc1E9Q043 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Fndc1E9Q043 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Fndc1E9Q043 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Fndc1E9Q043 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Fndc1E9Q043 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Fndc1E9Q043 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Fndc1E9Q043 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Fndc1E9Q043 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Fndc1E9Q043 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Fndc1E9Q043 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Fndc1E9Q043 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Fndc1E9Q043 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Fndc1E9Q043 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Fndc1E9Q043 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Fndc1E9Q043 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Fndc1E9Q043 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
Fndc1E9Q043 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Fndc1E9Q043 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Fndc1E9Q043 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Fndc1E9Q043 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Fndc1E9Q043 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Fndc1E9Q043 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Fndc1E9Q043 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Fndc1E9Q043 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Fndc1E9Q043 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
Fndc1E9Q043 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Fndc1E9Q043 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
Fndc1E9Q043 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Fndc1E9Q043 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Fndc1E9Q043 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Fndc1E9Q043 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Fndc1E9Q043 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms