Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T1

Ccdc78, Coiled-coil domain-containing protein 78, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc78D3Z5T1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc78D3Z5T1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc78D3Z5T1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc78D3Z5T1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc78D3Z5T1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc78D3Z5T1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc78D3Z5T1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc78D3Z5T1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc78D3Z5T1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc78D3Z5T1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc78D3Z5T1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc78D3Z5T1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc78D3Z5T1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc78D3Z5T1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc78D3Z5T1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc78D3Z5T1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc78D3Z5T1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc78D3Z5T1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc78D3Z5T1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc78D3Z5T1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc78D3Z5T1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc78D3Z5T1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc78D3Z5T1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc78D3Z5T1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc78D3Z5T1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc78D3Z5T1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc78D3Z5T1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc78D3Z5T1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc78D3Z5T1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc78D3Z5T1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc78D3Z5T1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc78D3Z5T1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc78D3Z5T1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc78D3Z5T1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc78D3Z5T1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc78D3Z5T1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc78D3Z5T1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc78D3Z5T1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc78D3Z5T1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc78D3Z5T1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc78D3Z5T1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc78D3Z5T1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc78D3Z5T1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc78D3Z5T1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc78D3Z5T1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc78D3Z5T1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc78D3Z5T1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc78D3Z5T1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc78D3Z5T1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc78D3Z5T1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc78D3Z5T1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc78D3Z5T1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc78D3Z5T1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc78D3Z5T1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc78D3Z5T1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc78D3Z5T1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc78D3Z5T1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc78D3Z5T1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc78D3Z5T1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc78D3Z5T1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc78D3Z5T1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc78D3Z5T1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc78D3Z5T1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc78D3Z5T1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc78D3Z5T1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc78D3Z5T1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc78D3Z5T1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc78D3Z5T1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc78D3Z5T1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc78D3Z5T1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc78D3Z5T1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc78D3Z5T1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc78D3Z5T1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc78D3Z5T1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc78D3Z5T1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc78D3Z5T1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc78D3Z5T1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc78D3Z5T1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc78D3Z5T1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc78D3Z5T1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc78D3Z5T1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc78D3Z5T1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc78D3Z5T1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc78D3Z5T1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc78D3Z5T1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc78D3Z5T1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc78D3Z5T1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc78D3Z5T1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc78D3Z5T1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc78D3Z5T1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc78D3Z5T1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc78D3Z5T1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc78D3Z5T1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc78D3Z5T1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc78D3Z5T1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc78D3Z5T1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc78D3Z5T1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc78D3Z5T1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc78D3Z5T1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc78D3Z5T1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms