Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC1

Trappc11, Trafficking protein particle complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc11B2RXC1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trappc11B2RXC1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Trappc11B2RXC1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trappc11B2RXC1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trappc11B2RXC1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trappc11B2RXC1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trappc11B2RXC1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trappc11B2RXC1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trappc11B2RXC1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trappc11B2RXC1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trappc11B2RXC1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trappc11B2RXC1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trappc11B2RXC1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trappc11B2RXC1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Trappc11B2RXC1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trappc11B2RXC1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trappc11B2RXC1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Trappc11B2RXC1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trappc11B2RXC1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trappc11B2RXC1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trappc11B2RXC1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trappc11B2RXC1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trappc11B2RXC1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trappc11B2RXC1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trappc11B2RXC1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trappc11B2RXC1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trappc11B2RXC1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trappc11B2RXC1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trappc11B2RXC1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trappc11B2RXC1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trappc11B2RXC1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trappc11B2RXC1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trappc11B2RXC1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trappc11B2RXC1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trappc11B2RXC1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trappc11B2RXC1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trappc11B2RXC1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trappc11B2RXC1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trappc11B2RXC1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trappc11B2RXC1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trappc11B2RXC1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Trappc11B2RXC1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trappc11B2RXC1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trappc11B2RXC1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trappc11B2RXC1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trappc11B2RXC1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trappc11B2RXC1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trappc11B2RXC1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trappc11B2RXC1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trappc11B2RXC1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trappc11B2RXC1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trappc11B2RXC1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trappc11B2RXC1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trappc11B2RXC1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trappc11B2RXC1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trappc11B2RXC1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trappc11B2RXC1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trappc11B2RXC1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trappc11B2RXC1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trappc11B2RXC1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trappc11B2RXC1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trappc11B2RXC1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trappc11B2RXC1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trappc11B2RXC1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trappc11B2RXC1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trappc11B2RXC1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trappc11B2RXC1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trappc11B2RXC1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trappc11B2RXC1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trappc11B2RXC1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trappc11B2RXC1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trappc11B2RXC1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trappc11B2RXC1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trappc11B2RXC1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trappc11B2RXC1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trappc11B2RXC1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trappc11B2RXC1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trappc11B2RXC1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trappc11B2RXC1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Trappc11B2RXC1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trappc11B2RXC1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trappc11B2RXC1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trappc11B2RXC1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trappc11B2RXC1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trappc11B2RXC1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trappc11B2RXC1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trappc11B2RXC1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trappc11B2RXC1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trappc11B2RXC1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trappc11B2RXC1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trappc11B2RXC1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trappc11B2RXC1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trappc11B2RXC1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trappc11B2RXC1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Trappc11B2RXC1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trappc11B2RXC1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trappc11B2RXC1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trappc11B2RXC1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trappc11B2RXC1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trappc11B2RXC1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms