Protein–RNA interactions for Protein: B2RVB7

Hbb-bh2, Globin b2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh2B2RVB7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hbb-bh2B2RVB7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hbb-bh2B2RVB7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hbb-bh2B2RVB7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hbb-bh2B2RVB7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hbb-bh2B2RVB7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hbb-bh2B2RVB7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hbb-bh2B2RVB7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hbb-bh2B2RVB7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hbb-bh2B2RVB7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hbb-bh2B2RVB7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hbb-bh2B2RVB7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hbb-bh2B2RVB7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hbb-bh2B2RVB7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hbb-bh2B2RVB7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hbb-bh2B2RVB7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hbb-bh2B2RVB7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hbb-bh2B2RVB7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hbb-bh2B2RVB7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hbb-bh2B2RVB7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hbb-bh2B2RVB7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hbb-bh2B2RVB7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hbb-bh2B2RVB7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hbb-bh2B2RVB7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hbb-bh2B2RVB7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hbb-bh2B2RVB7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hbb-bh2B2RVB7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hbb-bh2B2RVB7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hbb-bh2B2RVB7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hbb-bh2B2RVB7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hbb-bh2B2RVB7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Hbb-bh2B2RVB7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Hbb-bh2B2RVB7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hbb-bh2B2RVB7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hbb-bh2B2RVB7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hbb-bh2B2RVB7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hbb-bh2B2RVB7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hbb-bh2B2RVB7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hbb-bh2B2RVB7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Hbb-bh2B2RVB7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hbb-bh2B2RVB7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hbb-bh2B2RVB7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hbb-bh2B2RVB7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hbb-bh2B2RVB7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hbb-bh2B2RVB7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hbb-bh2B2RVB7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hbb-bh2B2RVB7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hbb-bh2B2RVB7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hbb-bh2B2RVB7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hbb-bh2B2RVB7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hbb-bh2B2RVB7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hbb-bh2B2RVB7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hbb-bh2B2RVB7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hbb-bh2B2RVB7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hbb-bh2B2RVB7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hbb-bh2B2RVB7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hbb-bh2B2RVB7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hbb-bh2B2RVB7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hbb-bh2B2RVB7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hbb-bh2B2RVB7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hbb-bh2B2RVB7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hbb-bh2B2RVB7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hbb-bh2B2RVB7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hbb-bh2B2RVB7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hbb-bh2B2RVB7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hbb-bh2B2RVB7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hbb-bh2B2RVB7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hbb-bh2B2RVB7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hbb-bh2B2RVB7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hbb-bh2B2RVB7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hbb-bh2B2RVB7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hbb-bh2B2RVB7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hbb-bh2B2RVB7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hbb-bh2B2RVB7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hbb-bh2B2RVB7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hbb-bh2B2RVB7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hbb-bh2B2RVB7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hbb-bh2B2RVB7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Hbb-bh2B2RVB7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hbb-bh2B2RVB7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hbb-bh2B2RVB7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hbb-bh2B2RVB7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hbb-bh2B2RVB7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hbb-bh2B2RVB7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hbb-bh2B2RVB7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hbb-bh2B2RVB7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hbb-bh2B2RVB7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hbb-bh2B2RVB7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hbb-bh2B2RVB7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hbb-bh2B2RVB7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hbb-bh2B2RVB7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hbb-bh2B2RVB7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hbb-bh2B2RVB7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hbb-bh2B2RVB7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hbb-bh2B2RVB7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hbb-bh2B2RVB7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hbb-bh2B2RVB7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hbb-bh2B2RVB7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Hbb-bh2B2RVB7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms