Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtprbB2RU80 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprbB2RU80 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprbB2RU80 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprbB2RU80 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprbB2RU80 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprbB2RU80 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprbB2RU80 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprbB2RU80 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprbB2RU80 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtprbB2RU80 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PtprbB2RU80 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PtprbB2RU80 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PtprbB2RU80 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PtprbB2RU80 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PtprbB2RU80 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PtprbB2RU80 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PtprbB2RU80 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PtprbB2RU80 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PtprbB2RU80 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PtprbB2RU80 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PtprbB2RU80 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PtprbB2RU80 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PtprbB2RU80 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PtprbB2RU80 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PtprbB2RU80 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PtprbB2RU80 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PtprbB2RU80 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PtprbB2RU80 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PtprbB2RU80 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PtprbB2RU80 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtprbB2RU80 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtprbB2RU80 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtprbB2RU80 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtprbB2RU80 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprbB2RU80 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprbB2RU80 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprbB2RU80 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprbB2RU80 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprbB2RU80 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprbB2RU80 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprbB2RU80 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprbB2RU80 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprbB2RU80 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprbB2RU80 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprbB2RU80 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprbB2RU80 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprbB2RU80 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprbB2RU80 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PtprbB2RU80 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PtprbB2RU80 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PtprbB2RU80 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PtprbB2RU80 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PtprbB2RU80 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PtprbB2RU80 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PtprbB2RU80 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PtprbB2RU80 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PtprbB2RU80 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PtprbB2RU80 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PtprbB2RU80 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtprbB2RU80 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtprbB2RU80 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtprbB2RU80 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtprbB2RU80 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtprbB2RU80 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtprbB2RU80 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PtprbB2RU80 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprbB2RU80 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprbB2RU80 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprbB2RU80 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprbB2RU80 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprbB2RU80 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprbB2RU80 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprbB2RU80 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprbB2RU80 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprbB2RU80 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PtprbB2RU80 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtprbB2RU80 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PtprbB2RU80 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtprbB2RU80 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtprbB2RU80 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtprbB2RU80 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtprbB2RU80 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtprbB2RU80 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtprbB2RU80 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PtprbB2RU80 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PtprbB2RU80 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PtprbB2RU80 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PtprbB2RU80 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PtprbB2RU80 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PtprbB2RU80 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PtprbB2RU80 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PtprbB2RU80 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PtprbB2RU80 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PtprbB2RU80 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PtprbB2RU80 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
PtprbB2RU80 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtprbB2RU80 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtprbB2RU80 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtprbB2RU80 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.2 ms