Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trabd2bB1ATG9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trabd2bB1ATG9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trabd2bB1ATG9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trabd2bB1ATG9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trabd2bB1ATG9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trabd2bB1ATG9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trabd2bB1ATG9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trabd2bB1ATG9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trabd2bB1ATG9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trabd2bB1ATG9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trabd2bB1ATG9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trabd2bB1ATG9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trabd2bB1ATG9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trabd2bB1ATG9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trabd2bB1ATG9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trabd2bB1ATG9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Trabd2bB1ATG9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trabd2bB1ATG9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trabd2bB1ATG9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trabd2bB1ATG9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trabd2bB1ATG9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trabd2bB1ATG9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trabd2bB1ATG9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trabd2bB1ATG9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trabd2bB1ATG9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trabd2bB1ATG9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trabd2bB1ATG9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trabd2bB1ATG9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trabd2bB1ATG9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trabd2bB1ATG9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trabd2bB1ATG9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trabd2bB1ATG9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms