Protein–RNA interactions for Protein: B1AQJ2

Usp36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp36B1AQJ2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp36B1AQJ2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp36B1AQJ2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp36B1AQJ2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp36B1AQJ2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp36B1AQJ2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp36B1AQJ2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp36B1AQJ2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp36B1AQJ2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp36B1AQJ2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp36B1AQJ2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp36B1AQJ2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Usp36B1AQJ2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Usp36B1AQJ2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp36B1AQJ2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp36B1AQJ2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp36B1AQJ2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp36B1AQJ2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp36B1AQJ2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp36B1AQJ2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp36B1AQJ2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp36B1AQJ2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp36B1AQJ2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp36B1AQJ2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp36B1AQJ2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp36B1AQJ2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp36B1AQJ2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp36B1AQJ2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp36B1AQJ2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp36B1AQJ2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp36B1AQJ2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp36B1AQJ2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp36B1AQJ2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp36B1AQJ2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp36B1AQJ2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp36B1AQJ2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp36B1AQJ2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp36B1AQJ2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp36B1AQJ2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp36B1AQJ2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp36B1AQJ2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp36B1AQJ2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp36B1AQJ2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp36B1AQJ2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp36B1AQJ2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp36B1AQJ2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp36B1AQJ2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp36B1AQJ2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp36B1AQJ2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp36B1AQJ2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp36B1AQJ2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp36B1AQJ2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp36B1AQJ2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp36B1AQJ2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp36B1AQJ2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp36B1AQJ2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp36B1AQJ2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp36B1AQJ2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp36B1AQJ2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp36B1AQJ2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp36B1AQJ2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp36B1AQJ2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp36B1AQJ2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp36B1AQJ2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp36B1AQJ2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp36B1AQJ2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp36B1AQJ2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp36B1AQJ2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp36B1AQJ2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp36B1AQJ2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp36B1AQJ2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp36B1AQJ2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp36B1AQJ2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp36B1AQJ2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp36B1AQJ2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp36B1AQJ2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp36B1AQJ2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp36B1AQJ2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp36B1AQJ2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp36B1AQJ2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp36B1AQJ2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp36B1AQJ2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp36B1AQJ2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp36B1AQJ2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp36B1AQJ2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp36B1AQJ2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp36B1AQJ2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp36B1AQJ2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp36B1AQJ2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp36B1AQJ2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp36B1AQJ2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp36B1AQJ2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp36B1AQJ2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Usp36B1AQJ2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp36B1AQJ2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp36B1AQJ2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp36B1AQJ2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp36B1AQJ2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp36B1AQJ2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp36B1AQJ2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms