Protein–RNA interactions for Protein: A6H6T1

Prss40, Serine protease 40, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss40A6H6T1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Prss40A6H6T1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Prss40A6H6T1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Prss40A6H6T1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Prss40A6H6T1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Prss40A6H6T1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Prss40A6H6T1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prss40A6H6T1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prss40A6H6T1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prss40A6H6T1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prss40A6H6T1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prss40A6H6T1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prss40A6H6T1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prss40A6H6T1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prss40A6H6T1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prss40A6H6T1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Prss40A6H6T1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prss40A6H6T1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prss40A6H6T1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prss40A6H6T1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prss40A6H6T1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prss40A6H6T1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prss40A6H6T1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prss40A6H6T1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prss40A6H6T1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prss40A6H6T1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prss40A6H6T1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prss40A6H6T1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prss40A6H6T1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prss40A6H6T1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Prss40A6H6T1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Prss40A6H6T1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Prss40A6H6T1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Prss40A6H6T1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Prss40A6H6T1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Prss40A6H6T1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Prss40A6H6T1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prss40A6H6T1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prss40A6H6T1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prss40A6H6T1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prss40A6H6T1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prss40A6H6T1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prss40A6H6T1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prss40A6H6T1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prss40A6H6T1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prss40A6H6T1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prss40A6H6T1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prss40A6H6T1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prss40A6H6T1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prss40A6H6T1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prss40A6H6T1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prss40A6H6T1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prss40A6H6T1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prss40A6H6T1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prss40A6H6T1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prss40A6H6T1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prss40A6H6T1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prss40A6H6T1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prss40A6H6T1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prss40A6H6T1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prss40A6H6T1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Prss40A6H6T1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prss40A6H6T1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prss40A6H6T1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prss40A6H6T1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Prss40A6H6T1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prss40A6H6T1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prss40A6H6T1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prss40A6H6T1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prss40A6H6T1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prss40A6H6T1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prss40A6H6T1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prss40A6H6T1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prss40A6H6T1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prss40A6H6T1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prss40A6H6T1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Prss40A6H6T1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prss40A6H6T1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prss40A6H6T1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prss40A6H6T1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prss40A6H6T1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prss40A6H6T1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prss40A6H6T1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prss40A6H6T1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prss40A6H6T1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prss40A6H6T1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prss40A6H6T1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prss40A6H6T1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prss40A6H6T1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prss40A6H6T1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prss40A6H6T1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prss40A6H6T1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prss40A6H6T1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prss40A6H6T1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prss40A6H6T1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prss40A6H6T1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prss40A6H6T1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prss40A6H6T1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prss40A6H6T1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prss40A6H6T1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms