Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF7

Plcb2, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plcb2A3KGF7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Plcb2A3KGF7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Plcb2A3KGF7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Plcb2A3KGF7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Plcb2A3KGF7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Plcb2A3KGF7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Plcb2A3KGF7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Plcb2A3KGF7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Plcb2A3KGF7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Plcb2A3KGF7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Plcb2A3KGF7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Plcb2A3KGF7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Plcb2A3KGF7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Plcb2A3KGF7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Plcb2A3KGF7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Plcb2A3KGF7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Plcb2A3KGF7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Plcb2A3KGF7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Plcb2A3KGF7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Plcb2A3KGF7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Plcb2A3KGF7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Plcb2A3KGF7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Plcb2A3KGF7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Plcb2A3KGF7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Plcb2A3KGF7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Plcb2A3KGF7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Plcb2A3KGF7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Plcb2A3KGF7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Plcb2A3KGF7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Plcb2A3KGF7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Plcb2A3KGF7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Plcb2A3KGF7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Plcb2A3KGF7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Plcb2A3KGF7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Plcb2A3KGF7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Plcb2A3KGF7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Plcb2A3KGF7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Plcb2A3KGF7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Plcb2A3KGF7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Plcb2A3KGF7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Plcb2A3KGF7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Plcb2A3KGF7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Plcb2A3KGF7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Plcb2A3KGF7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Plcb2A3KGF7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Plcb2A3KGF7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Plcb2A3KGF7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Plcb2A3KGF7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Plcb2A3KGF7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Plcb2A3KGF7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Plcb2A3KGF7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Plcb2A3KGF7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Plcb2A3KGF7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Plcb2A3KGF7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Plcb2A3KGF7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Plcb2A3KGF7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Plcb2A3KGF7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Plcb2A3KGF7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Plcb2A3KGF7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Plcb2A3KGF7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Plcb2A3KGF7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Plcb2A3KGF7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Plcb2A3KGF7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Plcb2A3KGF7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Plcb2A3KGF7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Plcb2A3KGF7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Plcb2A3KGF7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Plcb2A3KGF7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Plcb2A3KGF7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Plcb2A3KGF7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Plcb2A3KGF7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Plcb2A3KGF7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Plcb2A3KGF7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Plcb2A3KGF7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Plcb2A3KGF7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Plcb2A3KGF7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Plcb2A3KGF7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Plcb2A3KGF7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Plcb2A3KGF7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Plcb2A3KGF7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Plcb2A3KGF7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Plcb2A3KGF7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Plcb2A3KGF7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Plcb2A3KGF7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Plcb2A3KGF7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Plcb2A3KGF7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Plcb2A3KGF7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Plcb2A3KGF7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Plcb2A3KGF7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Plcb2A3KGF7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Plcb2A3KGF7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Plcb2A3KGF7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Plcb2A3KGF7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Plcb2A3KGF7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Plcb2A3KGF7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Plcb2A3KGF7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Plcb2A3KGF7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Plcb2A3KGF7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Plcb2A3KGF7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Plcb2A3KGF7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms