Protein–RNA interactions for Protein: A2RSL7

4931406B18Rik, RIKEN cDNA 4931406B18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931406B18RikA2RSL7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.32■■□□□ 1
4931406B18RikA2RSL7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4931406B18RikA2RSL7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4931406B18RikA2RSL7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
4931406B18RikA2RSL7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4931406B18RikA2RSL7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
4931406B18RikA2RSL7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4931406B18RikA2RSL7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
4931406B18RikA2RSL7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4931406B18RikA2RSL7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4931406B18RikA2RSL7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.31■■□□□ 1
4931406B18RikA2RSL7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4931406B18RikA2RSL7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.3■■□□□ 1
4931406B18RikA2RSL7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
4931406B18RikA2RSL7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4931406B18RikA2RSL7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4931406B18RikA2RSL7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4931406B18RikA2RSL7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4931406B18RikA2RSL7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4931406B18RikA2RSL7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4931406B18RikA2RSL7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4931406B18RikA2RSL7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4931406B18RikA2RSL7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4931406B18RikA2RSL7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
4931406B18RikA2RSL7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4931406B18RikA2RSL7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
4931406B18RikA2RSL7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4931406B18RikA2RSL7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4931406B18RikA2RSL7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4931406B18RikA2RSL7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4931406B18RikA2RSL7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4931406B18RikA2RSL7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
4931406B18RikA2RSL7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
4931406B18RikA2RSL7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.28■■□□□ 1
4931406B18RikA2RSL7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
4931406B18RikA2RSL7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4931406B18RikA2RSL7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4931406B18RikA2RSL7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
4931406B18RikA2RSL7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
4931406B18RikA2RSL7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4931406B18RikA2RSL7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
4931406B18RikA2RSL7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4931406B18RikA2RSL7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4931406B18RikA2RSL7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4931406B18RikA2RSL7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4931406B18RikA2RSL7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
4931406B18RikA2RSL7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4931406B18RikA2RSL7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4931406B18RikA2RSL7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4931406B18RikA2RSL7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
4931406B18RikA2RSL7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4931406B18RikA2RSL7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
4931406B18RikA2RSL7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
4931406B18RikA2RSL7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
4931406B18RikA2RSL7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4931406B18RikA2RSL7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
4931406B18RikA2RSL7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4931406B18RikA2RSL7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4931406B18RikA2RSL7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4931406B18RikA2RSL7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4931406B18RikA2RSL7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4931406B18RikA2RSL7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
4931406B18RikA2RSL7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4931406B18RikA2RSL7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4931406B18RikA2RSL7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4931406B18RikA2RSL7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4931406B18RikA2RSL7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4931406B18RikA2RSL7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
4931406B18RikA2RSL7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4931406B18RikA2RSL7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
4931406B18RikA2RSL7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4931406B18RikA2RSL7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
4931406B18RikA2RSL7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
4931406B18RikA2RSL7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
4931406B18RikA2RSL7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4931406B18RikA2RSL7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
4931406B18RikA2RSL7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4931406B18RikA2RSL7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4931406B18RikA2RSL7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4931406B18RikA2RSL7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4931406B18RikA2RSL7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4931406B18RikA2RSL7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
4931406B18RikA2RSL7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4931406B18RikA2RSL7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4931406B18RikA2RSL7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4931406B18RikA2RSL7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4931406B18RikA2RSL7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4931406B18RikA2RSL7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
4931406B18RikA2RSL7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4931406B18RikA2RSL7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4931406B18RikA2RSL7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
4931406B18RikA2RSL7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
4931406B18RikA2RSL7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4931406B18RikA2RSL7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4931406B18RikA2RSL7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4931406B18RikA2RSL7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4931406B18RikA2RSL7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4931406B18RikA2RSL7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
4931406B18RikA2RSL7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
4931406B18RikA2RSL7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms