Protein–RNA interactions for Protein: A2ARA8

Itga8, Integrin alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,062 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga8A2ARA8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itga8A2ARA8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itga8A2ARA8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itga8A2ARA8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itga8A2ARA8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itga8A2ARA8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itga8A2ARA8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itga8A2ARA8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itga8A2ARA8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itga8A2ARA8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itga8A2ARA8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itga8A2ARA8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itga8A2ARA8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itga8A2ARA8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Itga8A2ARA8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itga8A2ARA8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itga8A2ARA8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itga8A2ARA8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itga8A2ARA8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itga8A2ARA8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itga8A2ARA8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itga8A2ARA8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itga8A2ARA8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itga8A2ARA8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itga8A2ARA8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itga8A2ARA8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itga8A2ARA8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itga8A2ARA8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itga8A2ARA8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itga8A2ARA8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itga8A2ARA8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Itga8A2ARA8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itga8A2ARA8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itga8A2ARA8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itga8A2ARA8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itga8A2ARA8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itga8A2ARA8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itga8A2ARA8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itga8A2ARA8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itga8A2ARA8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itga8A2ARA8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Itga8A2ARA8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itga8A2ARA8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itga8A2ARA8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itga8A2ARA8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itga8A2ARA8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itga8A2ARA8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itga8A2ARA8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itga8A2ARA8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itga8A2ARA8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itga8A2ARA8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itga8A2ARA8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itga8A2ARA8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itga8A2ARA8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itga8A2ARA8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itga8A2ARA8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itga8A2ARA8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itga8A2ARA8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itga8A2ARA8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itga8A2ARA8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itga8A2ARA8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itga8A2ARA8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itga8A2ARA8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itga8A2ARA8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itga8A2ARA8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itga8A2ARA8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itga8A2ARA8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itga8A2ARA8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itga8A2ARA8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itga8A2ARA8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itga8A2ARA8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itga8A2ARA8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itga8A2ARA8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itga8A2ARA8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itga8A2ARA8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Itga8A2ARA8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itga8A2ARA8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itga8A2ARA8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itga8A2ARA8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Itga8A2ARA8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Itga8A2ARA8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itga8A2ARA8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itga8A2ARA8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itga8A2ARA8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itga8A2ARA8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itga8A2ARA8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itga8A2ARA8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itga8A2ARA8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Itga8A2ARA8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itga8A2ARA8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itga8A2ARA8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itga8A2ARA8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Itga8A2ARA8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itga8A2ARA8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itga8A2ARA8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itga8A2ARA8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itga8A2ARA8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Itga8A2ARA8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itga8A2ARA8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Itga8A2ARA8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms