Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syndig1A2ANU3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syndig1A2ANU3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syndig1A2ANU3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syndig1A2ANU3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syndig1A2ANU3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syndig1A2ANU3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syndig1A2ANU3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syndig1A2ANU3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syndig1A2ANU3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syndig1A2ANU3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syndig1A2ANU3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syndig1A2ANU3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syndig1A2ANU3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syndig1A2ANU3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syndig1A2ANU3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syndig1A2ANU3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syndig1A2ANU3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syndig1A2ANU3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syndig1A2ANU3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syndig1A2ANU3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syndig1A2ANU3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syndig1A2ANU3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syndig1A2ANU3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syndig1A2ANU3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syndig1A2ANU3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syndig1A2ANU3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syndig1A2ANU3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syndig1A2ANU3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syndig1A2ANU3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syndig1A2ANU3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syndig1A2ANU3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syndig1A2ANU3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syndig1A2ANU3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Syndig1A2ANU3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syndig1A2ANU3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syndig1A2ANU3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Syndig1A2ANU3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Syndig1A2ANU3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Syndig1A2ANU3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Syndig1A2ANU3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Syndig1A2ANU3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Syndig1A2ANU3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syndig1A2ANU3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syndig1A2ANU3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syndig1A2ANU3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syndig1A2ANU3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syndig1A2ANU3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syndig1A2ANU3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syndig1A2ANU3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syndig1A2ANU3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syndig1A2ANU3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syndig1A2ANU3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Syndig1A2ANU3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syndig1A2ANU3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syndig1A2ANU3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syndig1A2ANU3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syndig1A2ANU3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Syndig1A2ANU3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syndig1A2ANU3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syndig1A2ANU3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syndig1A2ANU3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syndig1A2ANU3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syndig1A2ANU3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syndig1A2ANU3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Syndig1A2ANU3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syndig1A2ANU3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syndig1A2ANU3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syndig1A2ANU3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syndig1A2ANU3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syndig1A2ANU3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syndig1A2ANU3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syndig1A2ANU3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Syndig1A2ANU3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Syndig1A2ANU3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Syndig1A2ANU3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Syndig1A2ANU3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Syndig1A2ANU3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Syndig1A2ANU3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Syndig1A2ANU3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Syndig1A2ANU3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syndig1A2ANU3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syndig1A2ANU3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syndig1A2ANU3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syndig1A2ANU3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syndig1A2ANU3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syndig1A2ANU3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syndig1A2ANU3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syndig1A2ANU3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syndig1A2ANU3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syndig1A2ANU3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syndig1A2ANU3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syndig1A2ANU3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syndig1A2ANU3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syndig1A2ANU3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syndig1A2ANU3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syndig1A2ANU3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syndig1A2ANU3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Syndig1A2ANU3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syndig1A2ANU3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms