Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc163A2AGD7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc163A2AGD7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc163A2AGD7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc163A2AGD7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc163A2AGD7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc163A2AGD7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc163A2AGD7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc163A2AGD7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc163A2AGD7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc163A2AGD7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc163A2AGD7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc163A2AGD7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc163A2AGD7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc163A2AGD7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc163A2AGD7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc163A2AGD7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc163A2AGD7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc163A2AGD7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc163A2AGD7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc163A2AGD7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc163A2AGD7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc163A2AGD7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc163A2AGD7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc163A2AGD7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc163A2AGD7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc163A2AGD7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc163A2AGD7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc163A2AGD7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc163A2AGD7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc163A2AGD7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc163A2AGD7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc163A2AGD7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc163A2AGD7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc163A2AGD7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc163A2AGD7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc163A2AGD7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc163A2AGD7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc163A2AGD7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc163A2AGD7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc163A2AGD7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc163A2AGD7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc163A2AGD7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc163A2AGD7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc163A2AGD7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc163A2AGD7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc163A2AGD7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc163A2AGD7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc163A2AGD7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc163A2AGD7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc163A2AGD7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc163A2AGD7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc163A2AGD7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc163A2AGD7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc163A2AGD7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc163A2AGD7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc163A2AGD7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc163A2AGD7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc163A2AGD7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc163A2AGD7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc163A2AGD7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc163A2AGD7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc163A2AGD7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc163A2AGD7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc163A2AGD7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc163A2AGD7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc163A2AGD7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc163A2AGD7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc163A2AGD7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc163A2AGD7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc163A2AGD7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc163A2AGD7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc163A2AGD7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc163A2AGD7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc163A2AGD7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc163A2AGD7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc163A2AGD7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc163A2AGD7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc163A2AGD7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc163A2AGD7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc163A2AGD7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc163A2AGD7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc163A2AGD7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc163A2AGD7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc163A2AGD7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc163A2AGD7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc163A2AGD7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc163A2AGD7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc163A2AGD7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc163A2AGD7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc163A2AGD7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc163A2AGD7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc163A2AGD7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc163A2AGD7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc163A2AGD7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc163A2AGD7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc163A2AGD7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc163A2AGD7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc163A2AGD7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc163A2AGD7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms