Protein–RNA interactions for Protein: A2AAY5

Sh3pxd2b, SH3 and PX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3pxd2bA2AAY5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh3pxd2bA2AAY5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh3pxd2bA2AAY5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh3pxd2bA2AAY5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sh3pxd2bA2AAY5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh3pxd2bA2AAY5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh3pxd2bA2AAY5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh3pxd2bA2AAY5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sh3pxd2bA2AAY5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3pxd2bA2AAY5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3pxd2bA2AAY5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3pxd2bA2AAY5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3pxd2bA2AAY5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sh3pxd2bA2AAY5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh3pxd2bA2AAY5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh3pxd2bA2AAY5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh3pxd2bA2AAY5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3pxd2bA2AAY5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3pxd2bA2AAY5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3pxd2bA2AAY5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3pxd2bA2AAY5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3pxd2bA2AAY5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3pxd2bA2AAY5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3pxd2bA2AAY5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3pxd2bA2AAY5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3pxd2bA2AAY5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3pxd2bA2AAY5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3pxd2bA2AAY5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3pxd2bA2AAY5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3pxd2bA2AAY5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3pxd2bA2AAY5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3pxd2bA2AAY5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3pxd2bA2AAY5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3pxd2bA2AAY5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3pxd2bA2AAY5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3pxd2bA2AAY5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3pxd2bA2AAY5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3pxd2bA2AAY5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3pxd2bA2AAY5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3pxd2bA2AAY5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3pxd2bA2AAY5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3pxd2bA2AAY5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sh3pxd2bA2AAY5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sh3pxd2bA2AAY5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sh3pxd2bA2AAY5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh3pxd2bA2AAY5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh3pxd2bA2AAY5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3pxd2bA2AAY5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3pxd2bA2AAY5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3pxd2bA2AAY5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3pxd2bA2AAY5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3pxd2bA2AAY5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3pxd2bA2AAY5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3pxd2bA2AAY5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3pxd2bA2AAY5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3pxd2bA2AAY5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3pxd2bA2AAY5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3pxd2bA2AAY5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3pxd2bA2AAY5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3pxd2bA2AAY5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3pxd2bA2AAY5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3pxd2bA2AAY5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3pxd2bA2AAY5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3pxd2bA2AAY5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3pxd2bA2AAY5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3pxd2bA2AAY5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3pxd2bA2AAY5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3pxd2bA2AAY5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3pxd2bA2AAY5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3pxd2bA2AAY5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3pxd2bA2AAY5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3pxd2bA2AAY5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3pxd2bA2AAY5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3pxd2bA2AAY5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3pxd2bA2AAY5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3pxd2bA2AAY5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3pxd2bA2AAY5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3pxd2bA2AAY5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3pxd2bA2AAY5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3pxd2bA2AAY5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3pxd2bA2AAY5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3pxd2bA2AAY5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3pxd2bA2AAY5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh3pxd2bA2AAY5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh3pxd2bA2AAY5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh3pxd2bA2AAY5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh3pxd2bA2AAY5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh3pxd2bA2AAY5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh3pxd2bA2AAY5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh3pxd2bA2AAY5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh3pxd2bA2AAY5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh3pxd2bA2AAY5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sh3pxd2bA2AAY5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sh3pxd2bA2AAY5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sh3pxd2bA2AAY5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3pxd2bA2AAY5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3pxd2bA2AAY5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3pxd2bA2AAY5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3pxd2bA2AAY5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3pxd2bA2AAY5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms