Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pramef6A2A8M8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pramef6A2A8M8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pramef6A2A8M8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pramef6A2A8M8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pramef6A2A8M8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pramef6A2A8M8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pramef6A2A8M8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Pramef6A2A8M8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pramef6A2A8M8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pramef6A2A8M8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pramef6A2A8M8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pramef6A2A8M8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pramef6A2A8M8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pramef6A2A8M8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pramef6A2A8M8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pramef6A2A8M8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pramef6A2A8M8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pramef6A2A8M8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pramef6A2A8M8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pramef6A2A8M8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pramef6A2A8M8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pramef6A2A8M8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pramef6A2A8M8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pramef6A2A8M8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pramef6A2A8M8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pramef6A2A8M8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pramef6A2A8M8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Pramef6A2A8M8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pramef6A2A8M8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pramef6A2A8M8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pramef6A2A8M8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Pramef6A2A8M8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pramef6A2A8M8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pramef6A2A8M8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pramef6A2A8M8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pramef6A2A8M8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pramef6A2A8M8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pramef6A2A8M8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pramef6A2A8M8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pramef6A2A8M8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pramef6A2A8M8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pramef6A2A8M8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pramef6A2A8M8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pramef6A2A8M8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pramef6A2A8M8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Pramef6A2A8M8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pramef6A2A8M8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pramef6A2A8M8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pramef6A2A8M8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pramef6A2A8M8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pramef6A2A8M8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pramef6A2A8M8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pramef6A2A8M8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pramef6A2A8M8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pramef6A2A8M8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pramef6A2A8M8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pramef6A2A8M8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pramef6A2A8M8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pramef6A2A8M8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pramef6A2A8M8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pramef6A2A8M8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pramef6A2A8M8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Pramef6A2A8M8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Pramef6A2A8M8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pramef6A2A8M8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pramef6A2A8M8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Pramef6A2A8M8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Pramef6A2A8M8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Pramef6A2A8M8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pramef6A2A8M8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pramef6A2A8M8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pramef6A2A8M8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pramef6A2A8M8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pramef6A2A8M8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pramef6A2A8M8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pramef6A2A8M8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pramef6A2A8M8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pramef6A2A8M8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pramef6A2A8M8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pramef6A2A8M8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Pramef6A2A8M8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pramef6A2A8M8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pramef6A2A8M8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pramef6A2A8M8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pramef6A2A8M8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pramef6A2A8M8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pramef6A2A8M8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pramef6A2A8M8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pramef6A2A8M8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pramef6A2A8M8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pramef6A2A8M8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Pramef6A2A8M8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pramef6A2A8M8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Pramef6A2A8M8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pramef6A2A8M8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pramef6A2A8M8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pramef6A2A8M8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pramef6A2A8M8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pramef6A2A8M8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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