Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdc27A2A6Q5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdc27A2A6Q5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdc27A2A6Q5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdc27A2A6Q5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdc27A2A6Q5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdc27A2A6Q5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdc27A2A6Q5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdc27A2A6Q5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdc27A2A6Q5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdc27A2A6Q5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdc27A2A6Q5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdc27A2A6Q5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdc27A2A6Q5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdc27A2A6Q5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdc27A2A6Q5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdc27A2A6Q5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdc27A2A6Q5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdc27A2A6Q5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdc27A2A6Q5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdc27A2A6Q5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdc27A2A6Q5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdc27A2A6Q5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdc27A2A6Q5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdc27A2A6Q5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdc27A2A6Q5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdc27A2A6Q5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdc27A2A6Q5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdc27A2A6Q5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdc27A2A6Q5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdc27A2A6Q5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdc27A2A6Q5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdc27A2A6Q5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdc27A2A6Q5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cdc27A2A6Q5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cdc27A2A6Q5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdc27A2A6Q5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdc27A2A6Q5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdc27A2A6Q5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdc27A2A6Q5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdc27A2A6Q5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdc27A2A6Q5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdc27A2A6Q5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdc27A2A6Q5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdc27A2A6Q5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdc27A2A6Q5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdc27A2A6Q5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdc27A2A6Q5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdc27A2A6Q5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdc27A2A6Q5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdc27A2A6Q5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdc27A2A6Q5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdc27A2A6Q5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdc27A2A6Q5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdc27A2A6Q5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdc27A2A6Q5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdc27A2A6Q5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdc27A2A6Q5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdc27A2A6Q5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdc27A2A6Q5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdc27A2A6Q5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdc27A2A6Q5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdc27A2A6Q5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdc27A2A6Q5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdc27A2A6Q5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdc27A2A6Q5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cdc27A2A6Q5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cdc27A2A6Q5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdc27A2A6Q5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdc27A2A6Q5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdc27A2A6Q5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdc27A2A6Q5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdc27A2A6Q5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdc27A2A6Q5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdc27A2A6Q5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdc27A2A6Q5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdc27A2A6Q5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdc27A2A6Q5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdc27A2A6Q5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdc27A2A6Q5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdc27A2A6Q5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdc27A2A6Q5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdc27A2A6Q5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdc27A2A6Q5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdc27A2A6Q5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdc27A2A6Q5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdc27A2A6Q5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdc27A2A6Q5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdc27A2A6Q5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdc27A2A6Q5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdc27A2A6Q5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdc27A2A6Q5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdc27A2A6Q5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdc27A2A6Q5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdc27A2A6Q5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdc27A2A6Q5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdc27A2A6Q5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdc27A2A6Q5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdc27A2A6Q5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdc27A2A6Q5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms