Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Pkd2l1A2A259 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pkd2l1A2A259 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pkd2l1A2A259 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pkd2l1A2A259 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pkd2l1A2A259 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pkd2l1A2A259 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pkd2l1A2A259 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Pkd2l1A2A259 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pkd2l1A2A259 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pkd2l1A2A259 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pkd2l1A2A259 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pkd2l1A2A259 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pkd2l1A2A259 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pkd2l1A2A259 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pkd2l1A2A259 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pkd2l1A2A259 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pkd2l1A2A259 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pkd2l1A2A259 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pkd2l1A2A259 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pkd2l1A2A259 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pkd2l1A2A259 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pkd2l1A2A259 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pkd2l1A2A259 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkd2l1A2A259 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkd2l1A2A259 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkd2l1A2A259 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkd2l1A2A259 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkd2l1A2A259 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkd2l1A2A259 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkd2l1A2A259 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkd2l1A2A259 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkd2l1A2A259 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkd2l1A2A259 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkd2l1A2A259 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkd2l1A2A259 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkd2l1A2A259 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkd2l1A2A259 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkd2l1A2A259 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkd2l1A2A259 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkd2l1A2A259 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkd2l1A2A259 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkd2l1A2A259 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkd2l1A2A259 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkd2l1A2A259 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkd2l1A2A259 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkd2l1A2A259 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkd2l1A2A259 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkd2l1A2A259 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkd2l1A2A259 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkd2l1A2A259 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkd2l1A2A259 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkd2l1A2A259 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkd2l1A2A259 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkd2l1A2A259 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkd2l1A2A259 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkd2l1A2A259 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkd2l1A2A259 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkd2l1A2A259 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkd2l1A2A259 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkd2l1A2A259 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkd2l1A2A259 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkd2l1A2A259 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkd2l1A2A259 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkd2l1A2A259 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkd2l1A2A259 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pkd2l1A2A259 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pkd2l1A2A259 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pkd2l1A2A259 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pkd2l1A2A259 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pkd2l1A2A259 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pkd2l1A2A259 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pkd2l1A2A259 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pkd2l1A2A259 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pkd2l1A2A259 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pkd2l1A2A259 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pkd2l1A2A259 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pkd2l1A2A259 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pkd2l1A2A259 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pkd2l1A2A259 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pkd2l1A2A259 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pkd2l1A2A259 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pkd2l1A2A259 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pkd2l1A2A259 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pkd2l1A2A259 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pkd2l1A2A259 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pkd2l1A2A259 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pkd2l1A2A259 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pkd2l1A2A259 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pkd2l1A2A259 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pkd2l1A2A259 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pkd2l1A2A259 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pkd2l1A2A259 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pkd2l1A2A259 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pkd2l1A2A259 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pkd2l1A2A259 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pkd2l1A2A259 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pkd2l1A2A259 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pkd2l1A2A259 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pkd2l1A2A259 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 228.3 ms