Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP99

Ino80e, INO80 complex subunit E (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80eA0A0U1RP99 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ino80eA0A0U1RP99 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ino80eA0A0U1RP99 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ino80eA0A0U1RP99 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ino80eA0A0U1RP99 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ino80eA0A0U1RP99 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ino80eA0A0U1RP99 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ino80eA0A0U1RP99 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ino80eA0A0U1RP99 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ino80eA0A0U1RP99 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ino80eA0A0U1RP99 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ino80eA0A0U1RP99 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ino80eA0A0U1RP99 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ino80eA0A0U1RP99 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ino80eA0A0U1RP99 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ino80eA0A0U1RP99 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ino80eA0A0U1RP99 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ino80eA0A0U1RP99 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ino80eA0A0U1RP99 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ino80eA0A0U1RP99 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ino80eA0A0U1RP99 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ino80eA0A0U1RP99 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ino80eA0A0U1RP99 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ino80eA0A0U1RP99 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ino80eA0A0U1RP99 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ino80eA0A0U1RP99 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ino80eA0A0U1RP99 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ino80eA0A0U1RP99 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ino80eA0A0U1RP99 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ino80eA0A0U1RP99 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ino80eA0A0U1RP99 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ino80eA0A0U1RP99 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ino80eA0A0U1RP99 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ino80eA0A0U1RP99 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ino80eA0A0U1RP99 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ino80eA0A0U1RP99 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ino80eA0A0U1RP99 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ino80eA0A0U1RP99 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ino80eA0A0U1RP99 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ino80eA0A0U1RP99 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ino80eA0A0U1RP99 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ino80eA0A0U1RP99 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ino80eA0A0U1RP99 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ino80eA0A0U1RP99 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ino80eA0A0U1RP99 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ino80eA0A0U1RP99 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ino80eA0A0U1RP99 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ino80eA0A0U1RP99 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ino80eA0A0U1RP99 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ino80eA0A0U1RP99 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ino80eA0A0U1RP99 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ino80eA0A0U1RP99 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ino80eA0A0U1RP99 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ino80eA0A0U1RP99 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ino80eA0A0U1RP99 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ino80eA0A0U1RP99 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ino80eA0A0U1RP99 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ino80eA0A0U1RP99 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ino80eA0A0U1RP99 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ino80eA0A0U1RP99 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ino80eA0A0U1RP99 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ino80eA0A0U1RP99 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ino80eA0A0U1RP99 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ino80eA0A0U1RP99 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ino80eA0A0U1RP99 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ino80eA0A0U1RP99 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ino80eA0A0U1RP99 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ino80eA0A0U1RP99 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ino80eA0A0U1RP99 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ino80eA0A0U1RP99 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ino80eA0A0U1RP99 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ino80eA0A0U1RP99 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ino80eA0A0U1RP99 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ino80eA0A0U1RP99 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ino80eA0A0U1RP99 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ino80eA0A0U1RP99 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ino80eA0A0U1RP99 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ino80eA0A0U1RP99 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ino80eA0A0U1RP99 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ino80eA0A0U1RP99 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ino80eA0A0U1RP99 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ino80eA0A0U1RP99 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ino80eA0A0U1RP99 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ino80eA0A0U1RP99 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ino80eA0A0U1RP99 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ino80eA0A0U1RP99 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ino80eA0A0U1RP99 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ino80eA0A0U1RP99 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ino80eA0A0U1RP99 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ino80eA0A0U1RP99 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ino80eA0A0U1RP99 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ino80eA0A0U1RP99 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ino80eA0A0U1RP99 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ino80eA0A0U1RP99 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ino80eA0A0U1RP99 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ino80eA0A0U1RP99 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ino80eA0A0U1RP99 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ino80eA0A0U1RP99 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ino80eA0A0U1RP99 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ino80eA0A0U1RP99 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms