Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trbv13-1A0A0B4J1P8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trbv13-1A0A0B4J1P8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trbv13-1A0A0B4J1P8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trbv13-1A0A0B4J1P8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trbv13-1A0A0B4J1P8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trbv13-1A0A0B4J1P8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trbv13-1A0A0B4J1P8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trbv13-1A0A0B4J1P8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 210.8 ms