Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rps6ka4Q9Z2B9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rps6ka4Q9Z2B9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Rps6ka4Q9Z2B9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rps6ka4Q9Z2B9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rps6ka4Q9Z2B9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rps6ka4Q9Z2B9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rps6ka4Q9Z2B9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rps6ka4Q9Z2B9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rps6ka4Q9Z2B9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rps6ka4Q9Z2B9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rps6ka4Q9Z2B9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rps6ka4Q9Z2B9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms