Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccne2Q9Z238 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccne2Q9Z238 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccne2Q9Z238 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccne2Q9Z238 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccne2Q9Z238 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccne2Q9Z238 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccne2Q9Z238 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccne2Q9Z238 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccne2Q9Z238 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccne2Q9Z238 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccne2Q9Z238 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccne2Q9Z238 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccne2Q9Z238 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccne2Q9Z238 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccne2Q9Z238 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccne2Q9Z238 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccne2Q9Z238 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccne2Q9Z238 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccne2Q9Z238 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccne2Q9Z238 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccne2Q9Z238 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccne2Q9Z238 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccne2Q9Z238 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccne2Q9Z238 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccne2Q9Z238 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccne2Q9Z238 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccne2Q9Z238 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccne2Q9Z238 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccne2Q9Z238 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccne2Q9Z238 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccne2Q9Z238 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccne2Q9Z238 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccne2Q9Z238 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccne2Q9Z238 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccne2Q9Z238 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccne2Q9Z238 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccne2Q9Z238 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccne2Q9Z238 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccne2Q9Z238 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccne2Q9Z238 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccne2Q9Z238 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccne2Q9Z238 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccne2Q9Z238 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccne2Q9Z238 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccne2Q9Z238 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccne2Q9Z238 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccne2Q9Z238 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccne2Q9Z238 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccne2Q9Z238 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccne2Q9Z238 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccne2Q9Z238 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccne2Q9Z238 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccne2Q9Z238 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccne2Q9Z238 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccne2Q9Z238 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccne2Q9Z238 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccne2Q9Z238 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccne2Q9Z238 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccne2Q9Z238 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccne2Q9Z238 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccne2Q9Z238 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccne2Q9Z238 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccne2Q9Z238 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccne2Q9Z238 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccne2Q9Z238 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccne2Q9Z238 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccne2Q9Z238 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccne2Q9Z238 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccne2Q9Z238 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccne2Q9Z238 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccne2Q9Z238 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccne2Q9Z238 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccne2Q9Z238 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccne2Q9Z238 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccne2Q9Z238 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccne2Q9Z238 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccne2Q9Z238 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccne2Q9Z238 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccne2Q9Z238 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccne2Q9Z238 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccne2Q9Z238 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccne2Q9Z238 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccne2Q9Z238 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccne2Q9Z238 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccne2Q9Z238 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccne2Q9Z238 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccne2Q9Z238 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccne2Q9Z238 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccne2Q9Z238 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccne2Q9Z238 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccne2Q9Z238 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccne2Q9Z238 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccne2Q9Z238 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccne2Q9Z238 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccne2Q9Z238 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccne2Q9Z238 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccne2Q9Z238 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccne2Q9Z238 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccne2Q9Z238 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms