Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx39bQ9Z1N5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx39bQ9Z1N5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx39bQ9Z1N5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx39bQ9Z1N5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx39bQ9Z1N5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx39bQ9Z1N5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx39bQ9Z1N5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx39bQ9Z1N5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx39bQ9Z1N5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx39bQ9Z1N5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx39bQ9Z1N5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx39bQ9Z1N5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx39bQ9Z1N5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx39bQ9Z1N5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx39bQ9Z1N5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx39bQ9Z1N5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx39bQ9Z1N5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx39bQ9Z1N5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx39bQ9Z1N5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx39bQ9Z1N5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx39bQ9Z1N5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx39bQ9Z1N5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx39bQ9Z1N5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx39bQ9Z1N5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ddx39bQ9Z1N5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx39bQ9Z1N5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx39bQ9Z1N5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx39bQ9Z1N5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx39bQ9Z1N5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx39bQ9Z1N5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx39bQ9Z1N5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx39bQ9Z1N5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx39bQ9Z1N5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ddx39bQ9Z1N5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx39bQ9Z1N5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx39bQ9Z1N5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx39bQ9Z1N5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx39bQ9Z1N5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx39bQ9Z1N5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx39bQ9Z1N5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx39bQ9Z1N5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx39bQ9Z1N5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx39bQ9Z1N5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx39bQ9Z1N5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx39bQ9Z1N5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx39bQ9Z1N5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx39bQ9Z1N5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx39bQ9Z1N5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx39bQ9Z1N5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx39bQ9Z1N5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx39bQ9Z1N5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx39bQ9Z1N5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx39bQ9Z1N5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx39bQ9Z1N5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx39bQ9Z1N5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx39bQ9Z1N5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx39bQ9Z1N5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx39bQ9Z1N5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx39bQ9Z1N5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx39bQ9Z1N5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx39bQ9Z1N5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx39bQ9Z1N5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddx39bQ9Z1N5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddx39bQ9Z1N5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddx39bQ9Z1N5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddx39bQ9Z1N5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddx39bQ9Z1N5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddx39bQ9Z1N5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddx39bQ9Z1N5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx39bQ9Z1N5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx39bQ9Z1N5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx39bQ9Z1N5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx39bQ9Z1N5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx39bQ9Z1N5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx39bQ9Z1N5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx39bQ9Z1N5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddx39bQ9Z1N5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddx39bQ9Z1N5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddx39bQ9Z1N5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddx39bQ9Z1N5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddx39bQ9Z1N5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddx39bQ9Z1N5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddx39bQ9Z1N5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddx39bQ9Z1N5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddx39bQ9Z1N5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddx39bQ9Z1N5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddx39bQ9Z1N5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx39bQ9Z1N5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx39bQ9Z1N5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx39bQ9Z1N5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx39bQ9Z1N5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx39bQ9Z1N5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms