Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1M4

Rps6kb2, Ribosomal protein S6 kinase beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6kb2Q9Z1M4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rps6kb2Q9Z1M4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rps6kb2Q9Z1M4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps6kb2Q9Z1M4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps6kb2Q9Z1M4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rps6kb2Q9Z1M4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps6kb2Q9Z1M4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps6kb2Q9Z1M4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps6kb2Q9Z1M4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps6kb2Q9Z1M4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps6kb2Q9Z1M4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps6kb2Q9Z1M4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps6kb2Q9Z1M4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps6kb2Q9Z1M4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps6kb2Q9Z1M4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps6kb2Q9Z1M4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps6kb2Q9Z1M4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps6kb2Q9Z1M4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rps6kb2Q9Z1M4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rps6kb2Q9Z1M4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rps6kb2Q9Z1M4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rps6kb2Q9Z1M4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rps6kb2Q9Z1M4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rps6kb2Q9Z1M4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rps6kb2Q9Z1M4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rps6kb2Q9Z1M4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rps6kb2Q9Z1M4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rps6kb2Q9Z1M4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rps6kb2Q9Z1M4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rps6kb2Q9Z1M4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rps6kb2Q9Z1M4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rps6kb2Q9Z1M4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rps6kb2Q9Z1M4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rps6kb2Q9Z1M4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rps6kb2Q9Z1M4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rps6kb2Q9Z1M4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rps6kb2Q9Z1M4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rps6kb2Q9Z1M4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rps6kb2Q9Z1M4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rps6kb2Q9Z1M4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rps6kb2Q9Z1M4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps6kb2Q9Z1M4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps6kb2Q9Z1M4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps6kb2Q9Z1M4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps6kb2Q9Z1M4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps6kb2Q9Z1M4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rps6kb2Q9Z1M4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rps6kb2Q9Z1M4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rps6kb2Q9Z1M4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rps6kb2Q9Z1M4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rps6kb2Q9Z1M4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rps6kb2Q9Z1M4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rps6kb2Q9Z1M4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rps6kb2Q9Z1M4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rps6kb2Q9Z1M4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rps6kb2Q9Z1M4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rps6kb2Q9Z1M4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps6kb2Q9Z1M4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps6kb2Q9Z1M4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps6kb2Q9Z1M4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps6kb2Q9Z1M4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps6kb2Q9Z1M4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps6kb2Q9Z1M4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps6kb2Q9Z1M4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rps6kb2Q9Z1M4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rps6kb2Q9Z1M4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rps6kb2Q9Z1M4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rps6kb2Q9Z1M4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rps6kb2Q9Z1M4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rps6kb2Q9Z1M4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps6kb2Q9Z1M4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps6kb2Q9Z1M4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps6kb2Q9Z1M4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rps6kb2Q9Z1M4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rps6kb2Q9Z1M4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rps6kb2Q9Z1M4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rps6kb2Q9Z1M4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rps6kb2Q9Z1M4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rps6kb2Q9Z1M4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rps6kb2Q9Z1M4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rps6kb2Q9Z1M4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps6kb2Q9Z1M4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps6kb2Q9Z1M4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps6kb2Q9Z1M4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps6kb2Q9Z1M4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps6kb2Q9Z1M4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps6kb2Q9Z1M4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps6kb2Q9Z1M4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps6kb2Q9Z1M4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps6kb2Q9Z1M4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps6kb2Q9Z1M4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps6kb2Q9Z1M4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps6kb2Q9Z1M4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps6kb2Q9Z1M4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps6kb2Q9Z1M4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rps6kb2Q9Z1M4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rps6kb2Q9Z1M4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rps6kb2Q9Z1M4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rps6kb2Q9Z1M4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rps6kb2Q9Z1M4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms