Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0T9

Itgb6, Integrin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb6Q9Z0T9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itgb6Q9Z0T9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itgb6Q9Z0T9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itgb6Q9Z0T9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itgb6Q9Z0T9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Itgb6Q9Z0T9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Itgb6Q9Z0T9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Itgb6Q9Z0T9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itgb6Q9Z0T9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itgb6Q9Z0T9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Itgb6Q9Z0T9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Itgb6Q9Z0T9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itgb6Q9Z0T9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itgb6Q9Z0T9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itgb6Q9Z0T9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itgb6Q9Z0T9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Itgb6Q9Z0T9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itgb6Q9Z0T9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itgb6Q9Z0T9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itgb6Q9Z0T9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itgb6Q9Z0T9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itgb6Q9Z0T9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itgb6Q9Z0T9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itgb6Q9Z0T9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itgb6Q9Z0T9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itgb6Q9Z0T9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itgb6Q9Z0T9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itgb6Q9Z0T9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itgb6Q9Z0T9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itgb6Q9Z0T9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itgb6Q9Z0T9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itgb6Q9Z0T9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Itgb6Q9Z0T9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Itgb6Q9Z0T9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itgb6Q9Z0T9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itgb6Q9Z0T9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itgb6Q9Z0T9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itgb6Q9Z0T9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itgb6Q9Z0T9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itgb6Q9Z0T9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itgb6Q9Z0T9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itgb6Q9Z0T9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itgb6Q9Z0T9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itgb6Q9Z0T9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itgb6Q9Z0T9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itgb6Q9Z0T9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Itgb6Q9Z0T9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Itgb6Q9Z0T9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Itgb6Q9Z0T9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Itgb6Q9Z0T9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Itgb6Q9Z0T9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itgb6Q9Z0T9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itgb6Q9Z0T9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itgb6Q9Z0T9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itgb6Q9Z0T9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itgb6Q9Z0T9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itgb6Q9Z0T9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itgb6Q9Z0T9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itgb6Q9Z0T9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itgb6Q9Z0T9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itgb6Q9Z0T9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itgb6Q9Z0T9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itgb6Q9Z0T9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itgb6Q9Z0T9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itgb6Q9Z0T9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itgb6Q9Z0T9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Itgb6Q9Z0T9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itgb6Q9Z0T9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itgb6Q9Z0T9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itgb6Q9Z0T9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itgb6Q9Z0T9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itgb6Q9Z0T9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itgb6Q9Z0T9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itgb6Q9Z0T9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itgb6Q9Z0T9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Itgb6Q9Z0T9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itgb6Q9Z0T9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itgb6Q9Z0T9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itgb6Q9Z0T9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itgb6Q9Z0T9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itgb6Q9Z0T9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itgb6Q9Z0T9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itgb6Q9Z0T9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itgb6Q9Z0T9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itgb6Q9Z0T9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itgb6Q9Z0T9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itgb6Q9Z0T9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itgb6Q9Z0T9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itgb6Q9Z0T9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itgb6Q9Z0T9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Itgb6Q9Z0T9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Itgb6Q9Z0T9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Itgb6Q9Z0T9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Itgb6Q9Z0T9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Itgb6Q9Z0T9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Itgb6Q9Z0T9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Itgb6Q9Z0T9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itgb6Q9Z0T9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itgb6Q9Z0T9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itgb6Q9Z0T9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms