Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PapolbQ9WVP6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PapolbQ9WVP6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PapolbQ9WVP6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PapolbQ9WVP6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PapolbQ9WVP6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PapolbQ9WVP6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PapolbQ9WVP6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PapolbQ9WVP6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PapolbQ9WVP6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PapolbQ9WVP6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PapolbQ9WVP6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PapolbQ9WVP6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PapolbQ9WVP6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PapolbQ9WVP6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PapolbQ9WVP6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PapolbQ9WVP6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PapolbQ9WVP6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PapolbQ9WVP6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PapolbQ9WVP6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PapolbQ9WVP6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PapolbQ9WVP6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PapolbQ9WVP6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PapolbQ9WVP6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PapolbQ9WVP6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PapolbQ9WVP6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PapolbQ9WVP6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PapolbQ9WVP6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PapolbQ9WVP6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PapolbQ9WVP6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PapolbQ9WVP6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PapolbQ9WVP6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PapolbQ9WVP6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PapolbQ9WVP6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PapolbQ9WVP6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PapolbQ9WVP6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PapolbQ9WVP6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PapolbQ9WVP6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PapolbQ9WVP6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PapolbQ9WVP6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PapolbQ9WVP6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PapolbQ9WVP6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PapolbQ9WVP6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PapolbQ9WVP6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PapolbQ9WVP6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PapolbQ9WVP6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PapolbQ9WVP6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PapolbQ9WVP6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PapolbQ9WVP6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PapolbQ9WVP6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PapolbQ9WVP6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PapolbQ9WVP6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PapolbQ9WVP6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PapolbQ9WVP6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PapolbQ9WVP6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PapolbQ9WVP6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PapolbQ9WVP6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PapolbQ9WVP6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PapolbQ9WVP6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PapolbQ9WVP6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PapolbQ9WVP6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PapolbQ9WVP6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PapolbQ9WVP6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PapolbQ9WVP6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PapolbQ9WVP6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PapolbQ9WVP6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PapolbQ9WVP6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PapolbQ9WVP6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PapolbQ9WVP6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PapolbQ9WVP6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PapolbQ9WVP6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PapolbQ9WVP6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PapolbQ9WVP6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PapolbQ9WVP6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PapolbQ9WVP6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PapolbQ9WVP6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PapolbQ9WVP6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PapolbQ9WVP6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PapolbQ9WVP6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PapolbQ9WVP6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PapolbQ9WVP6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PapolbQ9WVP6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PapolbQ9WVP6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PapolbQ9WVP6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PapolbQ9WVP6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PapolbQ9WVP6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PapolbQ9WVP6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PapolbQ9WVP6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PapolbQ9WVP6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PapolbQ9WVP6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PapolbQ9WVP6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PapolbQ9WVP6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PapolbQ9WVP6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PapolbQ9WVP6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PapolbQ9WVP6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PapolbQ9WVP6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PapolbQ9WVP6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PapolbQ9WVP6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PapolbQ9WVP6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PapolbQ9WVP6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms