Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L6

Pcm1, Pericentriolar material 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcm1Q9R0L6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcm1Q9R0L6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcm1Q9R0L6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcm1Q9R0L6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcm1Q9R0L6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcm1Q9R0L6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcm1Q9R0L6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcm1Q9R0L6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcm1Q9R0L6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcm1Q9R0L6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcm1Q9R0L6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcm1Q9R0L6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcm1Q9R0L6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcm1Q9R0L6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcm1Q9R0L6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcm1Q9R0L6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcm1Q9R0L6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcm1Q9R0L6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcm1Q9R0L6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcm1Q9R0L6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcm1Q9R0L6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcm1Q9R0L6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcm1Q9R0L6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pcm1Q9R0L6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcm1Q9R0L6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcm1Q9R0L6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcm1Q9R0L6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcm1Q9R0L6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcm1Q9R0L6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcm1Q9R0L6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcm1Q9R0L6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcm1Q9R0L6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcm1Q9R0L6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcm1Q9R0L6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcm1Q9R0L6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcm1Q9R0L6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcm1Q9R0L6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcm1Q9R0L6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcm1Q9R0L6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcm1Q9R0L6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcm1Q9R0L6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcm1Q9R0L6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcm1Q9R0L6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcm1Q9R0L6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcm1Q9R0L6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcm1Q9R0L6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcm1Q9R0L6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcm1Q9R0L6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcm1Q9R0L6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcm1Q9R0L6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcm1Q9R0L6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Pcm1Q9R0L6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcm1Q9R0L6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcm1Q9R0L6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcm1Q9R0L6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcm1Q9R0L6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcm1Q9R0L6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcm1Q9R0L6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcm1Q9R0L6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcm1Q9R0L6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcm1Q9R0L6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcm1Q9R0L6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcm1Q9R0L6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcm1Q9R0L6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcm1Q9R0L6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcm1Q9R0L6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcm1Q9R0L6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcm1Q9R0L6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcm1Q9R0L6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcm1Q9R0L6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcm1Q9R0L6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcm1Q9R0L6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcm1Q9R0L6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcm1Q9R0L6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcm1Q9R0L6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcm1Q9R0L6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcm1Q9R0L6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcm1Q9R0L6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcm1Q9R0L6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcm1Q9R0L6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcm1Q9R0L6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcm1Q9R0L6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcm1Q9R0L6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcm1Q9R0L6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcm1Q9R0L6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcm1Q9R0L6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcm1Q9R0L6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcm1Q9R0L6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcm1Q9R0L6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcm1Q9R0L6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcm1Q9R0L6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcm1Q9R0L6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcm1Q9R0L6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcm1Q9R0L6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcm1Q9R0L6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcm1Q9R0L6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcm1Q9R0L6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcm1Q9R0L6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcm1Q9R0L6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcm1Q9R0L6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms