Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Zeb2Q9R0G7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Zeb2Q9R0G7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Zeb2Q9R0G7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Zeb2Q9R0G7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Zeb2Q9R0G7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Zeb2Q9R0G7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Zeb2Q9R0G7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Zeb2Q9R0G7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Zeb2Q9R0G7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Zeb2Q9R0G7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Zeb2Q9R0G7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Zeb2Q9R0G7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Zeb2Q9R0G7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Zeb2Q9R0G7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Zeb2Q9R0G7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Zeb2Q9R0G7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Zeb2Q9R0G7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Zeb2Q9R0G7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Zeb2Q9R0G7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Zeb2Q9R0G7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Zeb2Q9R0G7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Zeb2Q9R0G7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Zeb2Q9R0G7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Zeb2Q9R0G7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Zeb2Q9R0G7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Zeb2Q9R0G7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Zeb2Q9R0G7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Zeb2Q9R0G7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Zeb2Q9R0G7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Zeb2Q9R0G7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Zeb2Q9R0G7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Zeb2Q9R0G7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Zeb2Q9R0G7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Zeb2Q9R0G7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Zeb2Q9R0G7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Zeb2Q9R0G7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Zeb2Q9R0G7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Zeb2Q9R0G7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Zeb2Q9R0G7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Zeb2Q9R0G7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Zeb2Q9R0G7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Zeb2Q9R0G7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Zeb2Q9R0G7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Zeb2Q9R0G7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Zeb2Q9R0G7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Zeb2Q9R0G7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Zeb2Q9R0G7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Zeb2Q9R0G7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Zeb2Q9R0G7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Zeb2Q9R0G7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Zeb2Q9R0G7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Zeb2Q9R0G7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Zeb2Q9R0G7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Zeb2Q9R0G7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Zeb2Q9R0G7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Zeb2Q9R0G7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Zeb2Q9R0G7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Zeb2Q9R0G7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Zeb2Q9R0G7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Zeb2Q9R0G7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Zeb2Q9R0G7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Zeb2Q9R0G7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Zeb2Q9R0G7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Zeb2Q9R0G7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Zeb2Q9R0G7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Zeb2Q9R0G7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Zeb2Q9R0G7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Zeb2Q9R0G7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Zeb2Q9R0G7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Zeb2Q9R0G7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Zeb2Q9R0G7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Zeb2Q9R0G7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Zeb2Q9R0G7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Zeb2Q9R0G7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Zeb2Q9R0G7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Zeb2Q9R0G7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Zeb2Q9R0G7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Zeb2Q9R0G7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Zeb2Q9R0G7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Zeb2Q9R0G7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Zeb2Q9R0G7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Zeb2Q9R0G7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Zeb2Q9R0G7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Zeb2Q9R0G7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Zeb2Q9R0G7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Zeb2Q9R0G7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Zeb2Q9R0G7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Zeb2Q9R0G7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Zeb2Q9R0G7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Zeb2Q9R0G7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Zeb2Q9R0G7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Zeb2Q9R0G7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Zeb2Q9R0G7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Zeb2Q9R0G7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Zeb2Q9R0G7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Zeb2Q9R0G7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Zeb2Q9R0G7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Zeb2Q9R0G7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Zeb2Q9R0G7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 169.1 ms