Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Irx4Q9QY61 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Irx4Q9QY61 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Irx4Q9QY61 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Irx4Q9QY61 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Irx4Q9QY61 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Irx4Q9QY61 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irx4Q9QY61 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irx4Q9QY61 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irx4Q9QY61 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irx4Q9QY61 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Irx4Q9QY61 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Irx4Q9QY61 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Irx4Q9QY61 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Irx4Q9QY61 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Irx4Q9QY61 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Irx4Q9QY61 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Irx4Q9QY61 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Irx4Q9QY61 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Irx4Q9QY61 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Irx4Q9QY61 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Irx4Q9QY61 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Irx4Q9QY61 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Irx4Q9QY61 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Irx4Q9QY61 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Irx4Q9QY61 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Irx4Q9QY61 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Irx4Q9QY61 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Irx4Q9QY61 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Irx4Q9QY61 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Irx4Q9QY61 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Irx4Q9QY61 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Irx4Q9QY61 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Irx4Q9QY61 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Irx4Q9QY61 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Irx4Q9QY61 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Irx4Q9QY61 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Irx4Q9QY61 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Irx4Q9QY61 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Irx4Q9QY61 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Irx4Q9QY61 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Irx4Q9QY61 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Irx4Q9QY61 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Irx4Q9QY61 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Irx4Q9QY61 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Irx4Q9QY61 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Irx4Q9QY61 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Irx4Q9QY61 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Irx4Q9QY61 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Irx4Q9QY61 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Irx4Q9QY61 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Irx4Q9QY61 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Irx4Q9QY61 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Irx4Q9QY61 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Irx4Q9QY61 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Irx4Q9QY61 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Irx4Q9QY61 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Irx4Q9QY61 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Irx4Q9QY61 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Irx4Q9QY61 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Irx4Q9QY61 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Irx4Q9QY61 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Irx4Q9QY61 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Irx4Q9QY61 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Irx4Q9QY61 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Irx4Q9QY61 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Irx4Q9QY61 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Irx4Q9QY61 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Irx4Q9QY61 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Irx4Q9QY61 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Irx4Q9QY61 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Irx4Q9QY61 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Irx4Q9QY61 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Irx4Q9QY61 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Irx4Q9QY61 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Irx4Q9QY61 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Irx4Q9QY61 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Irx4Q9QY61 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Irx4Q9QY61 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Irx4Q9QY61 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Irx4Q9QY61 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Irx4Q9QY61 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Irx4Q9QY61 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Irx4Q9QY61 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Irx4Q9QY61 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Irx4Q9QY61 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Irx4Q9QY61 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Irx4Q9QY61 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Irx4Q9QY61 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Irx4Q9QY61 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Irx4Q9QY61 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Irx4Q9QY61 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Irx4Q9QY61 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Irx4Q9QY61 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Irx4Q9QY61 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irx4Q9QY61 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irx4Q9QY61 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irx4Q9QY61 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Irx4Q9QY61 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Irx4Q9QY61 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms