Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLM8

Dclk1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk1Q9JLM8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dclk1Q9JLM8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dclk1Q9JLM8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dclk1Q9JLM8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dclk1Q9JLM8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dclk1Q9JLM8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dclk1Q9JLM8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dclk1Q9JLM8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Dclk1Q9JLM8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dclk1Q9JLM8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dclk1Q9JLM8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dclk1Q9JLM8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dclk1Q9JLM8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dclk1Q9JLM8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dclk1Q9JLM8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dclk1Q9JLM8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dclk1Q9JLM8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dclk1Q9JLM8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dclk1Q9JLM8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dclk1Q9JLM8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Dclk1Q9JLM8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dclk1Q9JLM8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dclk1Q9JLM8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Dclk1Q9JLM8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dclk1Q9JLM8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dclk1Q9JLM8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dclk1Q9JLM8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dclk1Q9JLM8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dclk1Q9JLM8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dclk1Q9JLM8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dclk1Q9JLM8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dclk1Q9JLM8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dclk1Q9JLM8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dclk1Q9JLM8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dclk1Q9JLM8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dclk1Q9JLM8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dclk1Q9JLM8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dclk1Q9JLM8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dclk1Q9JLM8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dclk1Q9JLM8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dclk1Q9JLM8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Dclk1Q9JLM8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dclk1Q9JLM8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dclk1Q9JLM8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Dclk1Q9JLM8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Dclk1Q9JLM8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Dclk1Q9JLM8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Dclk1Q9JLM8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dclk1Q9JLM8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dclk1Q9JLM8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dclk1Q9JLM8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dclk1Q9JLM8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dclk1Q9JLM8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dclk1Q9JLM8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dclk1Q9JLM8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dclk1Q9JLM8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dclk1Q9JLM8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dclk1Q9JLM8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dclk1Q9JLM8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dclk1Q9JLM8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dclk1Q9JLM8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dclk1Q9JLM8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dclk1Q9JLM8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Dclk1Q9JLM8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dclk1Q9JLM8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dclk1Q9JLM8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dclk1Q9JLM8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dclk1Q9JLM8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Dclk1Q9JLM8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dclk1Q9JLM8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dclk1Q9JLM8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dclk1Q9JLM8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dclk1Q9JLM8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dclk1Q9JLM8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dclk1Q9JLM8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dclk1Q9JLM8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dclk1Q9JLM8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dclk1Q9JLM8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dclk1Q9JLM8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dclk1Q9JLM8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dclk1Q9JLM8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dclk1Q9JLM8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dclk1Q9JLM8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dclk1Q9JLM8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dclk1Q9JLM8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Dclk1Q9JLM8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Dclk1Q9JLM8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dclk1Q9JLM8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dclk1Q9JLM8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dclk1Q9JLM8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Dclk1Q9JLM8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dclk1Q9JLM8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dclk1Q9JLM8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dclk1Q9JLM8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dclk1Q9JLM8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dclk1Q9JLM8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dclk1Q9JLM8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Dclk1Q9JLM8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dclk1Q9JLM8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dclk1Q9JLM8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms