Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col5a3Q9JLI2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Col5a3Q9JLI2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col5a3Q9JLI2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col5a3Q9JLI2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col5a3Q9JLI2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col5a3Q9JLI2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col5a3Q9JLI2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col5a3Q9JLI2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col5a3Q9JLI2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col5a3Q9JLI2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col5a3Q9JLI2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col5a3Q9JLI2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col5a3Q9JLI2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col5a3Q9JLI2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col5a3Q9JLI2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col5a3Q9JLI2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col5a3Q9JLI2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col5a3Q9JLI2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Col5a3Q9JLI2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Col5a3Q9JLI2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Col5a3Q9JLI2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col5a3Q9JLI2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Col5a3Q9JLI2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col5a3Q9JLI2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col5a3Q9JLI2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col5a3Q9JLI2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col5a3Q9JLI2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col5a3Q9JLI2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col5a3Q9JLI2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col5a3Q9JLI2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col5a3Q9JLI2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col5a3Q9JLI2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Col5a3Q9JLI2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col5a3Q9JLI2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col5a3Q9JLI2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col5a3Q9JLI2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col5a3Q9JLI2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col5a3Q9JLI2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col5a3Q9JLI2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col5a3Q9JLI2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col5a3Q9JLI2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col5a3Q9JLI2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col5a3Q9JLI2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col5a3Q9JLI2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col5a3Q9JLI2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col5a3Q9JLI2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col5a3Q9JLI2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col5a3Q9JLI2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col5a3Q9JLI2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col5a3Q9JLI2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col5a3Q9JLI2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col5a3Q9JLI2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col5a3Q9JLI2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col5a3Q9JLI2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col5a3Q9JLI2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col5a3Q9JLI2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col5a3Q9JLI2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col5a3Q9JLI2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col5a3Q9JLI2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col5a3Q9JLI2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col5a3Q9JLI2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col5a3Q9JLI2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Col5a3Q9JLI2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Col5a3Q9JLI2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Col5a3Q9JLI2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Col5a3Q9JLI2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col5a3Q9JLI2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col5a3Q9JLI2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col5a3Q9JLI2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col5a3Q9JLI2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col5a3Q9JLI2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col5a3Q9JLI2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col5a3Q9JLI2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col5a3Q9JLI2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col5a3Q9JLI2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col5a3Q9JLI2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col5a3Q9JLI2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col5a3Q9JLI2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col5a3Q9JLI2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col5a3Q9JLI2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col5a3Q9JLI2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col5a3Q9JLI2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col5a3Q9JLI2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col5a3Q9JLI2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col5a3Q9JLI2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col5a3Q9JLI2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col5a3Q9JLI2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Col5a3Q9JLI2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col5a3Q9JLI2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col5a3Q9JLI2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Col5a3Q9JLI2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col5a3Q9JLI2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col5a3Q9JLI2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col5a3Q9JLI2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col5a3Q9JLI2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms