Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX4

Aatf, Protein AATF, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AatfQ9JKX4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AatfQ9JKX4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AatfQ9JKX4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AatfQ9JKX4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AatfQ9JKX4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AatfQ9JKX4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AatfQ9JKX4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AatfQ9JKX4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AatfQ9JKX4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AatfQ9JKX4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AatfQ9JKX4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AatfQ9JKX4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AatfQ9JKX4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AatfQ9JKX4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AatfQ9JKX4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AatfQ9JKX4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AatfQ9JKX4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AatfQ9JKX4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AatfQ9JKX4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AatfQ9JKX4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AatfQ9JKX4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AatfQ9JKX4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AatfQ9JKX4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AatfQ9JKX4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AatfQ9JKX4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AatfQ9JKX4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AatfQ9JKX4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AatfQ9JKX4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AatfQ9JKX4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AatfQ9JKX4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
AatfQ9JKX4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AatfQ9JKX4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
AatfQ9JKX4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AatfQ9JKX4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
AatfQ9JKX4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AatfQ9JKX4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AatfQ9JKX4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AatfQ9JKX4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AatfQ9JKX4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AatfQ9JKX4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AatfQ9JKX4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AatfQ9JKX4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AatfQ9JKX4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AatfQ9JKX4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AatfQ9JKX4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AatfQ9JKX4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AatfQ9JKX4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AatfQ9JKX4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AatfQ9JKX4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AatfQ9JKX4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AatfQ9JKX4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AatfQ9JKX4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AatfQ9JKX4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AatfQ9JKX4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AatfQ9JKX4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AatfQ9JKX4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AatfQ9JKX4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AatfQ9JKX4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
AatfQ9JKX4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
AatfQ9JKX4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AatfQ9JKX4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AatfQ9JKX4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AatfQ9JKX4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AatfQ9JKX4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AatfQ9JKX4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AatfQ9JKX4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AatfQ9JKX4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AatfQ9JKX4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AatfQ9JKX4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AatfQ9JKX4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AatfQ9JKX4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AatfQ9JKX4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
AatfQ9JKX4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
AatfQ9JKX4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AatfQ9JKX4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AatfQ9JKX4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AatfQ9JKX4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AatfQ9JKX4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AatfQ9JKX4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AatfQ9JKX4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AatfQ9JKX4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AatfQ9JKX4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
AatfQ9JKX4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AatfQ9JKX4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AatfQ9JKX4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
AatfQ9JKX4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AatfQ9JKX4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AatfQ9JKX4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AatfQ9JKX4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AatfQ9JKX4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
AatfQ9JKX4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AatfQ9JKX4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AatfQ9JKX4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AatfQ9JKX4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AatfQ9JKX4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AatfQ9JKX4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AatfQ9JKX4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AatfQ9JKX4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AatfQ9JKX4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AatfQ9JKX4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms