Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKA5

Gpa33, Cell surface A33 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpa33Q9JKA5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gpa33Q9JKA5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gpa33Q9JKA5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gpa33Q9JKA5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gpa33Q9JKA5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gpa33Q9JKA5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gpa33Q9JKA5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gpa33Q9JKA5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gpa33Q9JKA5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gpa33Q9JKA5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gpa33Q9JKA5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gpa33Q9JKA5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gpa33Q9JKA5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gpa33Q9JKA5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gpa33Q9JKA5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gpa33Q9JKA5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gpa33Q9JKA5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gpa33Q9JKA5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gpa33Q9JKA5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gpa33Q9JKA5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gpa33Q9JKA5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gpa33Q9JKA5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpa33Q9JKA5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpa33Q9JKA5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpa33Q9JKA5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpa33Q9JKA5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpa33Q9JKA5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpa33Q9JKA5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpa33Q9JKA5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpa33Q9JKA5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpa33Q9JKA5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Gpa33Q9JKA5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpa33Q9JKA5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpa33Q9JKA5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpa33Q9JKA5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpa33Q9JKA5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpa33Q9JKA5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpa33Q9JKA5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpa33Q9JKA5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpa33Q9JKA5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gpa33Q9JKA5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpa33Q9JKA5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpa33Q9JKA5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpa33Q9JKA5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpa33Q9JKA5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpa33Q9JKA5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpa33Q9JKA5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpa33Q9JKA5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpa33Q9JKA5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpa33Q9JKA5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpa33Q9JKA5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpa33Q9JKA5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpa33Q9JKA5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpa33Q9JKA5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpa33Q9JKA5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpa33Q9JKA5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpa33Q9JKA5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpa33Q9JKA5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpa33Q9JKA5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpa33Q9JKA5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gpa33Q9JKA5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gpa33Q9JKA5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gpa33Q9JKA5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpa33Q9JKA5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpa33Q9JKA5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpa33Q9JKA5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpa33Q9JKA5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpa33Q9JKA5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpa33Q9JKA5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpa33Q9JKA5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpa33Q9JKA5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpa33Q9JKA5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpa33Q9JKA5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpa33Q9JKA5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpa33Q9JKA5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpa33Q9JKA5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpa33Q9JKA5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpa33Q9JKA5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpa33Q9JKA5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpa33Q9JKA5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpa33Q9JKA5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpa33Q9JKA5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpa33Q9JKA5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gpa33Q9JKA5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpa33Q9JKA5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpa33Q9JKA5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gpa33Q9JKA5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpa33Q9JKA5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpa33Q9JKA5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpa33Q9JKA5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpa33Q9JKA5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gpa33Q9JKA5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpa33Q9JKA5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpa33Q9JKA5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpa33Q9JKA5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpa33Q9JKA5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpa33Q9JKA5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpa33Q9JKA5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gpa33Q9JKA5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gpa33Q9JKA5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms