Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gfra4Q9JJT2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gfra4Q9JJT2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gfra4Q9JJT2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gfra4Q9JJT2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gfra4Q9JJT2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gfra4Q9JJT2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gfra4Q9JJT2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gfra4Q9JJT2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gfra4Q9JJT2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gfra4Q9JJT2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gfra4Q9JJT2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gfra4Q9JJT2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gfra4Q9JJT2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gfra4Q9JJT2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gfra4Q9JJT2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gfra4Q9JJT2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gfra4Q9JJT2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gfra4Q9JJT2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gfra4Q9JJT2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gfra4Q9JJT2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gfra4Q9JJT2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gfra4Q9JJT2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gfra4Q9JJT2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gfra4Q9JJT2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gfra4Q9JJT2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gfra4Q9JJT2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gfra4Q9JJT2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gfra4Q9JJT2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gfra4Q9JJT2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gfra4Q9JJT2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gfra4Q9JJT2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gfra4Q9JJT2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gfra4Q9JJT2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gfra4Q9JJT2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gfra4Q9JJT2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gfra4Q9JJT2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gfra4Q9JJT2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gfra4Q9JJT2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gfra4Q9JJT2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gfra4Q9JJT2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gfra4Q9JJT2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gfra4Q9JJT2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gfra4Q9JJT2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Gfra4Q9JJT2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gfra4Q9JJT2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gfra4Q9JJT2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gfra4Q9JJT2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gfra4Q9JJT2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Gfra4Q9JJT2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gfra4Q9JJT2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gfra4Q9JJT2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gfra4Q9JJT2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gfra4Q9JJT2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gfra4Q9JJT2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gfra4Q9JJT2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gfra4Q9JJT2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gfra4Q9JJT2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gfra4Q9JJT2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gfra4Q9JJT2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gfra4Q9JJT2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gfra4Q9JJT2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gfra4Q9JJT2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gfra4Q9JJT2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gfra4Q9JJT2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gfra4Q9JJT2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gfra4Q9JJT2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gfra4Q9JJT2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gfra4Q9JJT2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gfra4Q9JJT2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gfra4Q9JJT2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gfra4Q9JJT2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gfra4Q9JJT2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gfra4Q9JJT2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Gfra4Q9JJT2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gfra4Q9JJT2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gfra4Q9JJT2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gfra4Q9JJT2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gfra4Q9JJT2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gfra4Q9JJT2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gfra4Q9JJT2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Gfra4Q9JJT2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gfra4Q9JJT2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gfra4Q9JJT2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gfra4Q9JJT2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gfra4Q9JJT2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gfra4Q9JJT2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gfra4Q9JJT2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gfra4Q9JJT2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gfra4Q9JJT2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gfra4Q9JJT2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gfra4Q9JJT2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gfra4Q9JJT2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gfra4Q9JJT2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gfra4Q9JJT2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gfra4Q9JJT2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gfra4Q9JJT2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gfra4Q9JJT2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gfra4Q9JJT2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gfra4Q9JJT2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms