Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ26

Mefv, Pyrin, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MefvQ9JJ26 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MefvQ9JJ26 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MefvQ9JJ26 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MefvQ9JJ26 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MefvQ9JJ26 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MefvQ9JJ26 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MefvQ9JJ26 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MefvQ9JJ26 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MefvQ9JJ26 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MefvQ9JJ26 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MefvQ9JJ26 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MefvQ9JJ26 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MefvQ9JJ26 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MefvQ9JJ26 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MefvQ9JJ26 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MefvQ9JJ26 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MefvQ9JJ26 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MefvQ9JJ26 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MefvQ9JJ26 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MefvQ9JJ26 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MefvQ9JJ26 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MefvQ9JJ26 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MefvQ9JJ26 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MefvQ9JJ26 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MefvQ9JJ26 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MefvQ9JJ26 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MefvQ9JJ26 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MefvQ9JJ26 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MefvQ9JJ26 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MefvQ9JJ26 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MefvQ9JJ26 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MefvQ9JJ26 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MefvQ9JJ26 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MefvQ9JJ26 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MefvQ9JJ26 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MefvQ9JJ26 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MefvQ9JJ26 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MefvQ9JJ26 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MefvQ9JJ26 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MefvQ9JJ26 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MefvQ9JJ26 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MefvQ9JJ26 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MefvQ9JJ26 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MefvQ9JJ26 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MefvQ9JJ26 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MefvQ9JJ26 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MefvQ9JJ26 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MefvQ9JJ26 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MefvQ9JJ26 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MefvQ9JJ26 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MefvQ9JJ26 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MefvQ9JJ26 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MefvQ9JJ26 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MefvQ9JJ26 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MefvQ9JJ26 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MefvQ9JJ26 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MefvQ9JJ26 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MefvQ9JJ26 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MefvQ9JJ26 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MefvQ9JJ26 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MefvQ9JJ26 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MefvQ9JJ26 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MefvQ9JJ26 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MefvQ9JJ26 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MefvQ9JJ26 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MefvQ9JJ26 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MefvQ9JJ26 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MefvQ9JJ26 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MefvQ9JJ26 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MefvQ9JJ26 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MefvQ9JJ26 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MefvQ9JJ26 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MefvQ9JJ26 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MefvQ9JJ26 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MefvQ9JJ26 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MefvQ9JJ26 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MefvQ9JJ26 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MefvQ9JJ26 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MefvQ9JJ26 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MefvQ9JJ26 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MefvQ9JJ26 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MefvQ9JJ26 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MefvQ9JJ26 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MefvQ9JJ26 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MefvQ9JJ26 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MefvQ9JJ26 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MefvQ9JJ26 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MefvQ9JJ26 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MefvQ9JJ26 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MefvQ9JJ26 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MefvQ9JJ26 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MefvQ9JJ26 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MefvQ9JJ26 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MefvQ9JJ26 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MefvQ9JJ26 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MefvQ9JJ26 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MefvQ9JJ26 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MefvQ9JJ26 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MefvQ9JJ26 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MefvQ9JJ26 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms