Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER71

Rhoj, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhojQ9ER71 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RhojQ9ER71 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RhojQ9ER71 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RhojQ9ER71 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RhojQ9ER71 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RhojQ9ER71 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RhojQ9ER71 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RhojQ9ER71 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RhojQ9ER71 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RhojQ9ER71 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RhojQ9ER71 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RhojQ9ER71 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RhojQ9ER71 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RhojQ9ER71 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RhojQ9ER71 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RhojQ9ER71 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RhojQ9ER71 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RhojQ9ER71 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RhojQ9ER71 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RhojQ9ER71 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RhojQ9ER71 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RhojQ9ER71 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RhojQ9ER71 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RhojQ9ER71 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RhojQ9ER71 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RhojQ9ER71 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RhojQ9ER71 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RhojQ9ER71 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RhojQ9ER71 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RhojQ9ER71 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RhojQ9ER71 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RhojQ9ER71 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RhojQ9ER71 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RhojQ9ER71 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RhojQ9ER71 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RhojQ9ER71 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RhojQ9ER71 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RhojQ9ER71 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RhojQ9ER71 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RhojQ9ER71 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RhojQ9ER71 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RhojQ9ER71 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RhojQ9ER71 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RhojQ9ER71 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RhojQ9ER71 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RhojQ9ER71 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RhojQ9ER71 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RhojQ9ER71 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RhojQ9ER71 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RhojQ9ER71 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RhojQ9ER71 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RhojQ9ER71 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RhojQ9ER71 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RhojQ9ER71 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RhojQ9ER71 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RhojQ9ER71 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RhojQ9ER71 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RhojQ9ER71 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RhojQ9ER71 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RhojQ9ER71 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RhojQ9ER71 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RhojQ9ER71 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RhojQ9ER71 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RhojQ9ER71 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RhojQ9ER71 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RhojQ9ER71 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RhojQ9ER71 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RhojQ9ER71 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RhojQ9ER71 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RhojQ9ER71 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RhojQ9ER71 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RhojQ9ER71 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RhojQ9ER71 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RhojQ9ER71 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RhojQ9ER71 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RhojQ9ER71 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RhojQ9ER71 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RhojQ9ER71 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RhojQ9ER71 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RhojQ9ER71 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RhojQ9ER71 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RhojQ9ER71 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RhojQ9ER71 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RhojQ9ER71 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RhojQ9ER71 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RhojQ9ER71 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RhojQ9ER71 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RhojQ9ER71 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RhojQ9ER71 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RhojQ9ER71 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RhojQ9ER71 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RhojQ9ER71 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RhojQ9ER71 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RhojQ9ER71 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RhojQ9ER71 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RhojQ9ER71 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RhojQ9ER71 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RhojQ9ER71 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RhojQ9ER71 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RhojQ9ER71 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms