Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT2

Ndufs3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs3Q9DCT2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ndufs3Q9DCT2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ndufs3Q9DCT2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ndufs3Q9DCT2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndufs3Q9DCT2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndufs3Q9DCT2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndufs3Q9DCT2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndufs3Q9DCT2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndufs3Q9DCT2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndufs3Q9DCT2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndufs3Q9DCT2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndufs3Q9DCT2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndufs3Q9DCT2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndufs3Q9DCT2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndufs3Q9DCT2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndufs3Q9DCT2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndufs3Q9DCT2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndufs3Q9DCT2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndufs3Q9DCT2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndufs3Q9DCT2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndufs3Q9DCT2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndufs3Q9DCT2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndufs3Q9DCT2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndufs3Q9DCT2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndufs3Q9DCT2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndufs3Q9DCT2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ndufs3Q9DCT2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ndufs3Q9DCT2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ndufs3Q9DCT2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ndufs3Q9DCT2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ndufs3Q9DCT2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ndufs3Q9DCT2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ndufs3Q9DCT2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ndufs3Q9DCT2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ndufs3Q9DCT2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ndufs3Q9DCT2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ndufs3Q9DCT2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ndufs3Q9DCT2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ndufs3Q9DCT2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ndufs3Q9DCT2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ndufs3Q9DCT2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ndufs3Q9DCT2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ndufs3Q9DCT2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ndufs3Q9DCT2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ndufs3Q9DCT2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ndufs3Q9DCT2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ndufs3Q9DCT2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ndufs3Q9DCT2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ndufs3Q9DCT2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ndufs3Q9DCT2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ndufs3Q9DCT2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ndufs3Q9DCT2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ndufs3Q9DCT2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ndufs3Q9DCT2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ndufs3Q9DCT2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ndufs3Q9DCT2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ndufs3Q9DCT2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ndufs3Q9DCT2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ndufs3Q9DCT2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ndufs3Q9DCT2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ndufs3Q9DCT2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ndufs3Q9DCT2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ndufs3Q9DCT2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ndufs3Q9DCT2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ndufs3Q9DCT2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ndufs3Q9DCT2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ndufs3Q9DCT2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ndufs3Q9DCT2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ndufs3Q9DCT2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ndufs3Q9DCT2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ndufs3Q9DCT2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ndufs3Q9DCT2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ndufs3Q9DCT2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ndufs3Q9DCT2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ndufs3Q9DCT2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ndufs3Q9DCT2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ndufs3Q9DCT2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ndufs3Q9DCT2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ndufs3Q9DCT2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ndufs3Q9DCT2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ndufs3Q9DCT2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ndufs3Q9DCT2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ndufs3Q9DCT2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ndufs3Q9DCT2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ndufs3Q9DCT2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ndufs3Q9DCT2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ndufs3Q9DCT2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ndufs3Q9DCT2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ndufs3Q9DCT2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ndufs3Q9DCT2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ndufs3Q9DCT2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ndufs3Q9DCT2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ndufs3Q9DCT2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ndufs3Q9DCT2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ndufs3Q9DCT2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ndufs3Q9DCT2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ndufs3Q9DCT2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ndufs3Q9DCT2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ndufs3Q9DCT2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ndufs3Q9DCT2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms