Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hmg20aQ9DC33 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hmg20aQ9DC33 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hmg20aQ9DC33 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hmg20aQ9DC33 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hmg20aQ9DC33 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hmg20aQ9DC33 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hmg20aQ9DC33 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hmg20aQ9DC33 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hmg20aQ9DC33 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hmg20aQ9DC33 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hmg20aQ9DC33 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hmg20aQ9DC33 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hmg20aQ9DC33 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hmg20aQ9DC33 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hmg20aQ9DC33 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hmg20aQ9DC33 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hmg20aQ9DC33 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hmg20aQ9DC33 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hmg20aQ9DC33 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hmg20aQ9DC33 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hmg20aQ9DC33 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hmg20aQ9DC33 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hmg20aQ9DC33 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hmg20aQ9DC33 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hmg20aQ9DC33 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hmg20aQ9DC33 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hmg20aQ9DC33 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hmg20aQ9DC33 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hmg20aQ9DC33 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hmg20aQ9DC33 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hmg20aQ9DC33 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hmg20aQ9DC33 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hmg20aQ9DC33 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hmg20aQ9DC33 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hmg20aQ9DC33 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hmg20aQ9DC33 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hmg20aQ9DC33 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hmg20aQ9DC33 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hmg20aQ9DC33 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hmg20aQ9DC33 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hmg20aQ9DC33 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hmg20aQ9DC33 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hmg20aQ9DC33 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hmg20aQ9DC33 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hmg20aQ9DC33 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hmg20aQ9DC33 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hmg20aQ9DC33 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hmg20aQ9DC33 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hmg20aQ9DC33 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hmg20aQ9DC33 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hmg20aQ9DC33 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hmg20aQ9DC33 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hmg20aQ9DC33 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Hmg20aQ9DC33 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hmg20aQ9DC33 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hmg20aQ9DC33 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hmg20aQ9DC33 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hmg20aQ9DC33 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hmg20aQ9DC33 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hmg20aQ9DC33 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hmg20aQ9DC33 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hmg20aQ9DC33 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hmg20aQ9DC33 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hmg20aQ9DC33 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hmg20aQ9DC33 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hmg20aQ9DC33 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hmg20aQ9DC33 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hmg20aQ9DC33 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hmg20aQ9DC33 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hmg20aQ9DC33 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hmg20aQ9DC33 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Hmg20aQ9DC33 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hmg20aQ9DC33 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hmg20aQ9DC33 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hmg20aQ9DC33 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hmg20aQ9DC33 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hmg20aQ9DC33 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hmg20aQ9DC33 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hmg20aQ9DC33 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hmg20aQ9DC33 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hmg20aQ9DC33 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hmg20aQ9DC33 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hmg20aQ9DC33 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hmg20aQ9DC33 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hmg20aQ9DC33 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hmg20aQ9DC33 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hmg20aQ9DC33 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Hmg20aQ9DC33 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hmg20aQ9DC33 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hmg20aQ9DC33 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hmg20aQ9DC33 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hmg20aQ9DC33 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hmg20aQ9DC33 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hmg20aQ9DC33 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hmg20aQ9DC33 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Hmg20aQ9DC33 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hmg20aQ9DC33 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hmg20aQ9DC33 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hmg20aQ9DC33 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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