Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rsph3bQ9DA80 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Rsph3bQ9DA80 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rsph3bQ9DA80 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rsph3bQ9DA80 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rsph3bQ9DA80 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rsph3bQ9DA80 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rsph3bQ9DA80 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rsph3bQ9DA80 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rsph3bQ9DA80 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rsph3bQ9DA80 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rsph3bQ9DA80 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rsph3bQ9DA80 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rsph3bQ9DA80 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rsph3bQ9DA80 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rsph3bQ9DA80 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rsph3bQ9DA80 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rsph3bQ9DA80 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rsph3bQ9DA80 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Rsph3bQ9DA80 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rsph3bQ9DA80 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rsph3bQ9DA80 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rsph3bQ9DA80 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rsph3bQ9DA80 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rsph3bQ9DA80 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rsph3bQ9DA80 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rsph3bQ9DA80 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rsph3bQ9DA80 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rsph3bQ9DA80 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rsph3bQ9DA80 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rsph3bQ9DA80 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rsph3bQ9DA80 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rsph3bQ9DA80 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rsph3bQ9DA80 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rsph3bQ9DA80 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rsph3bQ9DA80 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rsph3bQ9DA80 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rsph3bQ9DA80 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rsph3bQ9DA80 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rsph3bQ9DA80 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rsph3bQ9DA80 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rsph3bQ9DA80 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rsph3bQ9DA80 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rsph3bQ9DA80 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rsph3bQ9DA80 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rsph3bQ9DA80 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rsph3bQ9DA80 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rsph3bQ9DA80 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rsph3bQ9DA80 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rsph3bQ9DA80 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rsph3bQ9DA80 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rsph3bQ9DA80 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rsph3bQ9DA80 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rsph3bQ9DA80 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rsph3bQ9DA80 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rsph3bQ9DA80 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rsph3bQ9DA80 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rsph3bQ9DA80 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rsph3bQ9DA80 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rsph3bQ9DA80 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rsph3bQ9DA80 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rsph3bQ9DA80 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rsph3bQ9DA80 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rsph3bQ9DA80 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rsph3bQ9DA80 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rsph3bQ9DA80 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rsph3bQ9DA80 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rsph3bQ9DA80 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rsph3bQ9DA80 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rsph3bQ9DA80 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rsph3bQ9DA80 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rsph3bQ9DA80 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rsph3bQ9DA80 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rsph3bQ9DA80 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rsph3bQ9DA80 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rsph3bQ9DA80 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rsph3bQ9DA80 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rsph3bQ9DA80 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rsph3bQ9DA80 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rsph3bQ9DA80 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rsph3bQ9DA80 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rsph3bQ9DA80 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rsph3bQ9DA80 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rsph3bQ9DA80 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rsph3bQ9DA80 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rsph3bQ9DA80 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rsph3bQ9DA80 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rsph3bQ9DA80 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rsph3bQ9DA80 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rsph3bQ9DA80 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rsph3bQ9DA80 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rsph3bQ9DA80 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rsph3bQ9DA80 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rsph3bQ9DA80 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rsph3bQ9DA80 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rsph3bQ9DA80 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rsph3bQ9DA80 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rsph3bQ9DA80 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rsph3bQ9DA80 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rsph3bQ9DA80 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms