Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sgf29Q9DA08 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sgf29Q9DA08 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sgf29Q9DA08 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sgf29Q9DA08 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sgf29Q9DA08 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sgf29Q9DA08 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sgf29Q9DA08 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sgf29Q9DA08 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sgf29Q9DA08 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sgf29Q9DA08 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sgf29Q9DA08 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sgf29Q9DA08 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sgf29Q9DA08 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sgf29Q9DA08 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Sgf29Q9DA08 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sgf29Q9DA08 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sgf29Q9DA08 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sgf29Q9DA08 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sgf29Q9DA08 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sgf29Q9DA08 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Sgf29Q9DA08 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sgf29Q9DA08 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sgf29Q9DA08 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Sgf29Q9DA08 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sgf29Q9DA08 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sgf29Q9DA08 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sgf29Q9DA08 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Sgf29Q9DA08 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sgf29Q9DA08 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sgf29Q9DA08 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sgf29Q9DA08 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sgf29Q9DA08 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sgf29Q9DA08 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sgf29Q9DA08 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sgf29Q9DA08 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sgf29Q9DA08 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sgf29Q9DA08 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sgf29Q9DA08 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sgf29Q9DA08 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sgf29Q9DA08 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sgf29Q9DA08 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sgf29Q9DA08 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sgf29Q9DA08 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Sgf29Q9DA08 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sgf29Q9DA08 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sgf29Q9DA08 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sgf29Q9DA08 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sgf29Q9DA08 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sgf29Q9DA08 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sgf29Q9DA08 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sgf29Q9DA08 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sgf29Q9DA08 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sgf29Q9DA08 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Sgf29Q9DA08 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sgf29Q9DA08 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sgf29Q9DA08 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sgf29Q9DA08 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sgf29Q9DA08 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Sgf29Q9DA08 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sgf29Q9DA08 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sgf29Q9DA08 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sgf29Q9DA08 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sgf29Q9DA08 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sgf29Q9DA08 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sgf29Q9DA08 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sgf29Q9DA08 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sgf29Q9DA08 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sgf29Q9DA08 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sgf29Q9DA08 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sgf29Q9DA08 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sgf29Q9DA08 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sgf29Q9DA08 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sgf29Q9DA08 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sgf29Q9DA08 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sgf29Q9DA08 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sgf29Q9DA08 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sgf29Q9DA08 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sgf29Q9DA08 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sgf29Q9DA08 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sgf29Q9DA08 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sgf29Q9DA08 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sgf29Q9DA08 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sgf29Q9DA08 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sgf29Q9DA08 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sgf29Q9DA08 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sgf29Q9DA08 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sgf29Q9DA08 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sgf29Q9DA08 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sgf29Q9DA08 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sgf29Q9DA08 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sgf29Q9DA08 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sgf29Q9DA08 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Sgf29Q9DA08 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sgf29Q9DA08 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sgf29Q9DA08 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sgf29Q9DA08 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sgf29Q9DA08 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sgf29Q9DA08 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sgf29Q9DA08 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms