Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7W5

Med8, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med8Q9D7W5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Med8Q9D7W5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Med8Q9D7W5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Med8Q9D7W5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Med8Q9D7W5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Med8Q9D7W5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Med8Q9D7W5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Med8Q9D7W5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Med8Q9D7W5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Med8Q9D7W5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Med8Q9D7W5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Med8Q9D7W5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Med8Q9D7W5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Med8Q9D7W5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Med8Q9D7W5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Med8Q9D7W5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Med8Q9D7W5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Med8Q9D7W5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Med8Q9D7W5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Med8Q9D7W5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Med8Q9D7W5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Med8Q9D7W5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Med8Q9D7W5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Med8Q9D7W5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Med8Q9D7W5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Med8Q9D7W5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Med8Q9D7W5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Med8Q9D7W5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Med8Q9D7W5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Med8Q9D7W5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Med8Q9D7W5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Med8Q9D7W5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Med8Q9D7W5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Med8Q9D7W5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Med8Q9D7W5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Med8Q9D7W5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Med8Q9D7W5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Med8Q9D7W5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Med8Q9D7W5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Med8Q9D7W5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Med8Q9D7W5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Med8Q9D7W5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Med8Q9D7W5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Med8Q9D7W5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Med8Q9D7W5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Med8Q9D7W5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Med8Q9D7W5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Med8Q9D7W5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Med8Q9D7W5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Med8Q9D7W5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Med8Q9D7W5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Med8Q9D7W5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Med8Q9D7W5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Med8Q9D7W5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Med8Q9D7W5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Med8Q9D7W5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Med8Q9D7W5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Med8Q9D7W5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Med8Q9D7W5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Med8Q9D7W5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Med8Q9D7W5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Med8Q9D7W5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Med8Q9D7W5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Med8Q9D7W5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Med8Q9D7W5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Med8Q9D7W5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Med8Q9D7W5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Med8Q9D7W5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med8Q9D7W5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med8Q9D7W5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med8Q9D7W5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med8Q9D7W5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med8Q9D7W5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med8Q9D7W5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med8Q9D7W5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med8Q9D7W5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Med8Q9D7W5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Med8Q9D7W5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Med8Q9D7W5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Med8Q9D7W5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Med8Q9D7W5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Med8Q9D7W5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Med8Q9D7W5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Med8Q9D7W5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Med8Q9D7W5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Med8Q9D7W5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Med8Q9D7W5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Med8Q9D7W5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Med8Q9D7W5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Med8Q9D7W5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Med8Q9D7W5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Med8Q9D7W5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Med8Q9D7W5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Med8Q9D7W5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Med8Q9D7W5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Med8Q9D7W5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Med8Q9D7W5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Med8Q9D7W5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Med8Q9D7W5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Med8Q9D7W5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms