Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7A6

Srp19, Signal recognition particle 19 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp19Q9D7A6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srp19Q9D7A6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srp19Q9D7A6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srp19Q9D7A6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srp19Q9D7A6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srp19Q9D7A6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srp19Q9D7A6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srp19Q9D7A6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Srp19Q9D7A6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Srp19Q9D7A6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srp19Q9D7A6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srp19Q9D7A6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srp19Q9D7A6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srp19Q9D7A6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Srp19Q9D7A6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srp19Q9D7A6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srp19Q9D7A6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srp19Q9D7A6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srp19Q9D7A6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srp19Q9D7A6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srp19Q9D7A6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srp19Q9D7A6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srp19Q9D7A6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Srp19Q9D7A6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srp19Q9D7A6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srp19Q9D7A6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srp19Q9D7A6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srp19Q9D7A6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srp19Q9D7A6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Srp19Q9D7A6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srp19Q9D7A6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Srp19Q9D7A6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srp19Q9D7A6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srp19Q9D7A6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Srp19Q9D7A6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Srp19Q9D7A6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srp19Q9D7A6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srp19Q9D7A6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srp19Q9D7A6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srp19Q9D7A6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srp19Q9D7A6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Srp19Q9D7A6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Srp19Q9D7A6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srp19Q9D7A6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srp19Q9D7A6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Srp19Q9D7A6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Srp19Q9D7A6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srp19Q9D7A6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srp19Q9D7A6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srp19Q9D7A6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srp19Q9D7A6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srp19Q9D7A6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srp19Q9D7A6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Srp19Q9D7A6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srp19Q9D7A6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srp19Q9D7A6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Srp19Q9D7A6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srp19Q9D7A6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srp19Q9D7A6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srp19Q9D7A6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srp19Q9D7A6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Srp19Q9D7A6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Srp19Q9D7A6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Srp19Q9D7A6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Srp19Q9D7A6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Srp19Q9D7A6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Srp19Q9D7A6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Srp19Q9D7A6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Srp19Q9D7A6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Srp19Q9D7A6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Srp19Q9D7A6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Srp19Q9D7A6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Srp19Q9D7A6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Srp19Q9D7A6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srp19Q9D7A6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srp19Q9D7A6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srp19Q9D7A6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srp19Q9D7A6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srp19Q9D7A6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srp19Q9D7A6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srp19Q9D7A6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Srp19Q9D7A6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srp19Q9D7A6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srp19Q9D7A6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srp19Q9D7A6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srp19Q9D7A6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Srp19Q9D7A6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srp19Q9D7A6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srp19Q9D7A6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srp19Q9D7A6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srp19Q9D7A6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srp19Q9D7A6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srp19Q9D7A6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Srp19Q9D7A6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srp19Q9D7A6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srp19Q9D7A6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Srp19Q9D7A6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srp19Q9D7A6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srp19Q9D7A6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Srp19Q9D7A6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms