Protein–RNA interactions for Protein: Q9D720

Nsmce1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce1Q9D720 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nsmce1Q9D720 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nsmce1Q9D720 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nsmce1Q9D720 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nsmce1Q9D720 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nsmce1Q9D720 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nsmce1Q9D720 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nsmce1Q9D720 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nsmce1Q9D720 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nsmce1Q9D720 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nsmce1Q9D720 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nsmce1Q9D720 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nsmce1Q9D720 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nsmce1Q9D720 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nsmce1Q9D720 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nsmce1Q9D720 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nsmce1Q9D720 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nsmce1Q9D720 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nsmce1Q9D720 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nsmce1Q9D720 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nsmce1Q9D720 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nsmce1Q9D720 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nsmce1Q9D720 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nsmce1Q9D720 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nsmce1Q9D720 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nsmce1Q9D720 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nsmce1Q9D720 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nsmce1Q9D720 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nsmce1Q9D720 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nsmce1Q9D720 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Nsmce1Q9D720 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nsmce1Q9D720 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nsmce1Q9D720 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nsmce1Q9D720 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nsmce1Q9D720 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nsmce1Q9D720 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Nsmce1Q9D720 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nsmce1Q9D720 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nsmce1Q9D720 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nsmce1Q9D720 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nsmce1Q9D720 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nsmce1Q9D720 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nsmce1Q9D720 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nsmce1Q9D720 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Nsmce1Q9D720 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nsmce1Q9D720 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nsmce1Q9D720 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nsmce1Q9D720 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nsmce1Q9D720 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nsmce1Q9D720 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nsmce1Q9D720 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nsmce1Q9D720 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nsmce1Q9D720 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nsmce1Q9D720 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nsmce1Q9D720 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nsmce1Q9D720 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nsmce1Q9D720 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nsmce1Q9D720 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nsmce1Q9D720 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Nsmce1Q9D720 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nsmce1Q9D720 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nsmce1Q9D720 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nsmce1Q9D720 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nsmce1Q9D720 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nsmce1Q9D720 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Nsmce1Q9D720 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nsmce1Q9D720 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Nsmce1Q9D720 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nsmce1Q9D720 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nsmce1Q9D720 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nsmce1Q9D720 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nsmce1Q9D720 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nsmce1Q9D720 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nsmce1Q9D720 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nsmce1Q9D720 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nsmce1Q9D720 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nsmce1Q9D720 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nsmce1Q9D720 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nsmce1Q9D720 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nsmce1Q9D720 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nsmce1Q9D720 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nsmce1Q9D720 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nsmce1Q9D720 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nsmce1Q9D720 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Nsmce1Q9D720 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nsmce1Q9D720 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nsmce1Q9D720 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nsmce1Q9D720 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nsmce1Q9D720 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nsmce1Q9D720 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nsmce1Q9D720 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nsmce1Q9D720 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nsmce1Q9D720 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nsmce1Q9D720 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nsmce1Q9D720 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nsmce1Q9D720 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nsmce1Q9D720 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nsmce1Q9D720 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nsmce1Q9D720 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nsmce1Q9D720 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.4 ms