Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6X5

Slc52a3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a3Q9D6X5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc52a3Q9D6X5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc52a3Q9D6X5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc52a3Q9D6X5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc52a3Q9D6X5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc52a3Q9D6X5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc52a3Q9D6X5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc52a3Q9D6X5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc52a3Q9D6X5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc52a3Q9D6X5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc52a3Q9D6X5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc52a3Q9D6X5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc52a3Q9D6X5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Slc52a3Q9D6X5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Slc52a3Q9D6X5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc52a3Q9D6X5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc52a3Q9D6X5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc52a3Q9D6X5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc52a3Q9D6X5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc52a3Q9D6X5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc52a3Q9D6X5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc52a3Q9D6X5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc52a3Q9D6X5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc52a3Q9D6X5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc52a3Q9D6X5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc52a3Q9D6X5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc52a3Q9D6X5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc52a3Q9D6X5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc52a3Q9D6X5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc52a3Q9D6X5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc52a3Q9D6X5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc52a3Q9D6X5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc52a3Q9D6X5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc52a3Q9D6X5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc52a3Q9D6X5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc52a3Q9D6X5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc52a3Q9D6X5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc52a3Q9D6X5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc52a3Q9D6X5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc52a3Q9D6X5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc52a3Q9D6X5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc52a3Q9D6X5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc52a3Q9D6X5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc52a3Q9D6X5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc52a3Q9D6X5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc52a3Q9D6X5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc52a3Q9D6X5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc52a3Q9D6X5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc52a3Q9D6X5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc52a3Q9D6X5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc52a3Q9D6X5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc52a3Q9D6X5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Slc52a3Q9D6X5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Slc52a3Q9D6X5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Slc52a3Q9D6X5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc52a3Q9D6X5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc52a3Q9D6X5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc52a3Q9D6X5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc52a3Q9D6X5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc52a3Q9D6X5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc52a3Q9D6X5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc52a3Q9D6X5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc52a3Q9D6X5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc52a3Q9D6X5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc52a3Q9D6X5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc52a3Q9D6X5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc52a3Q9D6X5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc52a3Q9D6X5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc52a3Q9D6X5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc52a3Q9D6X5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc52a3Q9D6X5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc52a3Q9D6X5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc52a3Q9D6X5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc52a3Q9D6X5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc52a3Q9D6X5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc52a3Q9D6X5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc52a3Q9D6X5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc52a3Q9D6X5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc52a3Q9D6X5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc52a3Q9D6X5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc52a3Q9D6X5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc52a3Q9D6X5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc52a3Q9D6X5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc52a3Q9D6X5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc52a3Q9D6X5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc52a3Q9D6X5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc52a3Q9D6X5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc52a3Q9D6X5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc52a3Q9D6X5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc52a3Q9D6X5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc52a3Q9D6X5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc52a3Q9D6X5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc52a3Q9D6X5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc52a3Q9D6X5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc52a3Q9D6X5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc52a3Q9D6X5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc52a3Q9D6X5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc52a3Q9D6X5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Slc52a3Q9D6X5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Slc52a3Q9D6X5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms