Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
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Ptp4a3Q9D658 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ptp4a3Q9D658 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ptp4a3Q9D658 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ptp4a3Q9D658 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ptp4a3Q9D658 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ptp4a3Q9D658 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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Ptp4a3Q9D658 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ptp4a3Q9D658 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ptp4a3Q9D658 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ptp4a3Q9D658 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ptp4a3Q9D658 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ptp4a3Q9D658 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ptp4a3Q9D658 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ptp4a3Q9D658 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ptp4a3Q9D658 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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Ptp4a3Q9D658 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ptp4a3Q9D658 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ptp4a3Q9D658 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ptp4a3Q9D658 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Ptp4a3Q9D658 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ptp4a3Q9D658 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Ptp4a3Q9D658 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ptp4a3Q9D658 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Ptp4a3Q9D658 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ptp4a3Q9D658 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ptp4a3Q9D658 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ptp4a3Q9D658 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ptp4a3Q9D658 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ptp4a3Q9D658 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ptp4a3Q9D658 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ptp4a3Q9D658 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ptp4a3Q9D658 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Ptp4a3Q9D658 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ptp4a3Q9D658 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ptp4a3Q9D658 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Ptp4a3Q9D658 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ptp4a3Q9D658 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Ptp4a3Q9D658 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ptp4a3Q9D658 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ptp4a3Q9D658 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ptp4a3Q9D658 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ptp4a3Q9D658 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ptp4a3Q9D658 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ptp4a3Q9D658 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ptp4a3Q9D658 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ptp4a3Q9D658 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ptp4a3Q9D658 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ptp4a3Q9D658 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ptp4a3Q9D658 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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Ptp4a3Q9D658 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ptp4a3Q9D658 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ptp4a3Q9D658 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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Ptp4a3Q9D658 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ptp4a3Q9D658 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ptp4a3Q9D658 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ptp4a3Q9D658 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ptp4a3Q9D658 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ptp4a3Q9D658 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ptp4a3Q9D658 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ptp4a3Q9D658 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ptp4a3Q9D658 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ptp4a3Q9D658 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ptp4a3Q9D658 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ptp4a3Q9D658 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ptp4a3Q9D658 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ptp4a3Q9D658 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ptp4a3Q9D658 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ptp4a3Q9D658 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ptp4a3Q9D658 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ptp4a3Q9D658 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ptp4a3Q9D658 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ptp4a3Q9D658 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ptp4a3Q9D658 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ptp4a3Q9D658 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ptp4a3Q9D658 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ptp4a3Q9D658 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ptp4a3Q9D658 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Ptp4a3Q9D658 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Ptp4a3Q9D658 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ptp4a3Q9D658 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ptp4a3Q9D658 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ptp4a3Q9D658 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ptp4a3Q9D658 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms