Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K7

Ccdc105, Coiled-coil domain-containing protein 105, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc105Q9D4K7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc105Q9D4K7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc105Q9D4K7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc105Q9D4K7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc105Q9D4K7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc105Q9D4K7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc105Q9D4K7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc105Q9D4K7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc105Q9D4K7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc105Q9D4K7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc105Q9D4K7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc105Q9D4K7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc105Q9D4K7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc105Q9D4K7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc105Q9D4K7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc105Q9D4K7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc105Q9D4K7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc105Q9D4K7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc105Q9D4K7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc105Q9D4K7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc105Q9D4K7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc105Q9D4K7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc105Q9D4K7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc105Q9D4K7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc105Q9D4K7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc105Q9D4K7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc105Q9D4K7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc105Q9D4K7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc105Q9D4K7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc105Q9D4K7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc105Q9D4K7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc105Q9D4K7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc105Q9D4K7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc105Q9D4K7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc105Q9D4K7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc105Q9D4K7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc105Q9D4K7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc105Q9D4K7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc105Q9D4K7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc105Q9D4K7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc105Q9D4K7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc105Q9D4K7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc105Q9D4K7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc105Q9D4K7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc105Q9D4K7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc105Q9D4K7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc105Q9D4K7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc105Q9D4K7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc105Q9D4K7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc105Q9D4K7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc105Q9D4K7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc105Q9D4K7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc105Q9D4K7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc105Q9D4K7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc105Q9D4K7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc105Q9D4K7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc105Q9D4K7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc105Q9D4K7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc105Q9D4K7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc105Q9D4K7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc105Q9D4K7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc105Q9D4K7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc105Q9D4K7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc105Q9D4K7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc105Q9D4K7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc105Q9D4K7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc105Q9D4K7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc105Q9D4K7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc105Q9D4K7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc105Q9D4K7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc105Q9D4K7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc105Q9D4K7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc105Q9D4K7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc105Q9D4K7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc105Q9D4K7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc105Q9D4K7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc105Q9D4K7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc105Q9D4K7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc105Q9D4K7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc105Q9D4K7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc105Q9D4K7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc105Q9D4K7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc105Q9D4K7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc105Q9D4K7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc105Q9D4K7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc105Q9D4K7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc105Q9D4K7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc105Q9D4K7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc105Q9D4K7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc105Q9D4K7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc105Q9D4K7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc105Q9D4K7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc105Q9D4K7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc105Q9D4K7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc105Q9D4K7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc105Q9D4K7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc105Q9D4K7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc105Q9D4K7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc105Q9D4K7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc105Q9D4K7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms