Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Stag1Q9D3E6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Stag1Q9D3E6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Stag1Q9D3E6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Stag1Q9D3E6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Stag1Q9D3E6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Stag1Q9D3E6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Stag1Q9D3E6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Stag1Q9D3E6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Stag1Q9D3E6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Stag1Q9D3E6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Stag1Q9D3E6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Stag1Q9D3E6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Stag1Q9D3E6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Stag1Q9D3E6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Stag1Q9D3E6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Stag1Q9D3E6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Stag1Q9D3E6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Stag1Q9D3E6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Stag1Q9D3E6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Stag1Q9D3E6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Stag1Q9D3E6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Stag1Q9D3E6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Stag1Q9D3E6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Stag1Q9D3E6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Stag1Q9D3E6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Stag1Q9D3E6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Stag1Q9D3E6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Stag1Q9D3E6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Stag1Q9D3E6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Stag1Q9D3E6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Stag1Q9D3E6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Stag1Q9D3E6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Stag1Q9D3E6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Stag1Q9D3E6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Stag1Q9D3E6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Stag1Q9D3E6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Stag1Q9D3E6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Stag1Q9D3E6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Stag1Q9D3E6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Stag1Q9D3E6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Stag1Q9D3E6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Stag1Q9D3E6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Stag1Q9D3E6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Stag1Q9D3E6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Stag1Q9D3E6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Stag1Q9D3E6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Stag1Q9D3E6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Stag1Q9D3E6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Stag1Q9D3E6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Stag1Q9D3E6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Stag1Q9D3E6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Stag1Q9D3E6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Stag1Q9D3E6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Stag1Q9D3E6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Stag1Q9D3E6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Stag1Q9D3E6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Stag1Q9D3E6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Stag1Q9D3E6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Stag1Q9D3E6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Stag1Q9D3E6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Stag1Q9D3E6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Stag1Q9D3E6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Stag1Q9D3E6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Stag1Q9D3E6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Stag1Q9D3E6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Stag1Q9D3E6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Stag1Q9D3E6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Stag1Q9D3E6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Stag1Q9D3E6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Stag1Q9D3E6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Stag1Q9D3E6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Stag1Q9D3E6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Stag1Q9D3E6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Stag1Q9D3E6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Stag1Q9D3E6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Stag1Q9D3E6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Stag1Q9D3E6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Stag1Q9D3E6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Stag1Q9D3E6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Stag1Q9D3E6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Stag1Q9D3E6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Stag1Q9D3E6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Stag1Q9D3E6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Stag1Q9D3E6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Stag1Q9D3E6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Stag1Q9D3E6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Stag1Q9D3E6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Stag1Q9D3E6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Stag1Q9D3E6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Stag1Q9D3E6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Stag1Q9D3E6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Stag1Q9D3E6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Stag1Q9D3E6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Stag1Q9D3E6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Stag1Q9D3E6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Stag1Q9D3E6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Stag1Q9D3E6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Stag1Q9D3E6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Stag1Q9D3E6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms