Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hddc3Q9D114 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hddc3Q9D114 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hddc3Q9D114 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hddc3Q9D114 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hddc3Q9D114 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hddc3Q9D114 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hddc3Q9D114 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hddc3Q9D114 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hddc3Q9D114 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hddc3Q9D114 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hddc3Q9D114 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hddc3Q9D114 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hddc3Q9D114 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hddc3Q9D114 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hddc3Q9D114 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hddc3Q9D114 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hddc3Q9D114 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hddc3Q9D114 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Hddc3Q9D114 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hddc3Q9D114 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hddc3Q9D114 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hddc3Q9D114 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hddc3Q9D114 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hddc3Q9D114 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hddc3Q9D114 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hddc3Q9D114 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hddc3Q9D114 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hddc3Q9D114 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hddc3Q9D114 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hddc3Q9D114 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hddc3Q9D114 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hddc3Q9D114 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hddc3Q9D114 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hddc3Q9D114 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hddc3Q9D114 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Hddc3Q9D114 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hddc3Q9D114 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hddc3Q9D114 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hddc3Q9D114 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hddc3Q9D114 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hddc3Q9D114 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hddc3Q9D114 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hddc3Q9D114 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Hddc3Q9D114 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hddc3Q9D114 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hddc3Q9D114 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Hddc3Q9D114 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hddc3Q9D114 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Hddc3Q9D114 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hddc3Q9D114 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hddc3Q9D114 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hddc3Q9D114 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hddc3Q9D114 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hddc3Q9D114 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hddc3Q9D114 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hddc3Q9D114 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hddc3Q9D114 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hddc3Q9D114 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hddc3Q9D114 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hddc3Q9D114 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hddc3Q9D114 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hddc3Q9D114 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hddc3Q9D114 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hddc3Q9D114 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hddc3Q9D114 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hddc3Q9D114 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hddc3Q9D114 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hddc3Q9D114 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hddc3Q9D114 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hddc3Q9D114 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hddc3Q9D114 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hddc3Q9D114 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hddc3Q9D114 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hddc3Q9D114 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Hddc3Q9D114 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hddc3Q9D114 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hddc3Q9D114 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hddc3Q9D114 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hddc3Q9D114 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hddc3Q9D114 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hddc3Q9D114 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hddc3Q9D114 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hddc3Q9D114 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hddc3Q9D114 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hddc3Q9D114 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hddc3Q9D114 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hddc3Q9D114 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hddc3Q9D114 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Hddc3Q9D114 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hddc3Q9D114 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hddc3Q9D114 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hddc3Q9D114 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Hddc3Q9D114 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Hddc3Q9D114 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hddc3Q9D114 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hddc3Q9D114 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Hddc3Q9D114 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hddc3Q9D114 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hddc3Q9D114 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
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