Protein–RNA interactions for Protein: Q9D067

Mdm1, Nuclear protein MDM1, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdm1Q9D067 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mdm1Q9D067 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mdm1Q9D067 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Mdm1Q9D067 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mdm1Q9D067 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Mdm1Q9D067 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mdm1Q9D067 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mdm1Q9D067 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mdm1Q9D067 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mdm1Q9D067 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Mdm1Q9D067 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mdm1Q9D067 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mdm1Q9D067 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mdm1Q9D067 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mdm1Q9D067 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mdm1Q9D067 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mdm1Q9D067 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mdm1Q9D067 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mdm1Q9D067 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mdm1Q9D067 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mdm1Q9D067 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mdm1Q9D067 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mdm1Q9D067 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mdm1Q9D067 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mdm1Q9D067 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mdm1Q9D067 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mdm1Q9D067 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mdm1Q9D067 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mdm1Q9D067 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mdm1Q9D067 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mdm1Q9D067 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mdm1Q9D067 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mdm1Q9D067 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mdm1Q9D067 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mdm1Q9D067 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mdm1Q9D067 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mdm1Q9D067 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mdm1Q9D067 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mdm1Q9D067 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mdm1Q9D067 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mdm1Q9D067 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mdm1Q9D067 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mdm1Q9D067 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mdm1Q9D067 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mdm1Q9D067 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mdm1Q9D067 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mdm1Q9D067 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mdm1Q9D067 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mdm1Q9D067 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mdm1Q9D067 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mdm1Q9D067 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mdm1Q9D067 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Mdm1Q9D067 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Mdm1Q9D067 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mdm1Q9D067 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mdm1Q9D067 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mdm1Q9D067 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mdm1Q9D067 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mdm1Q9D067 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mdm1Q9D067 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mdm1Q9D067 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Mdm1Q9D067 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mdm1Q9D067 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mdm1Q9D067 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mdm1Q9D067 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mdm1Q9D067 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mdm1Q9D067 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mdm1Q9D067 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mdm1Q9D067 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mdm1Q9D067 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mdm1Q9D067 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mdm1Q9D067 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mdm1Q9D067 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mdm1Q9D067 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Mdm1Q9D067 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mdm1Q9D067 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mdm1Q9D067 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mdm1Q9D067 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mdm1Q9D067 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mdm1Q9D067 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mdm1Q9D067 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mdm1Q9D067 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mdm1Q9D067 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mdm1Q9D067 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mdm1Q9D067 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Mdm1Q9D067 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mdm1Q9D067 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mdm1Q9D067 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mdm1Q9D067 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mdm1Q9D067 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mdm1Q9D067 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mdm1Q9D067 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mdm1Q9D067 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Mdm1Q9D067 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Mdm1Q9D067 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mdm1Q9D067 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mdm1Q9D067 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Mdm1Q9D067 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mdm1Q9D067 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mdm1Q9D067 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms