Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT4

Polr3e, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3eQ9CZT4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Polr3eQ9CZT4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Polr3eQ9CZT4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Polr3eQ9CZT4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Polr3eQ9CZT4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Polr3eQ9CZT4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Polr3eQ9CZT4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Polr3eQ9CZT4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Polr3eQ9CZT4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Polr3eQ9CZT4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Polr3eQ9CZT4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Polr3eQ9CZT4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Polr3eQ9CZT4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Polr3eQ9CZT4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Polr3eQ9CZT4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Polr3eQ9CZT4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Polr3eQ9CZT4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Polr3eQ9CZT4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Polr3eQ9CZT4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Polr3eQ9CZT4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Polr3eQ9CZT4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Polr3eQ9CZT4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Polr3eQ9CZT4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Polr3eQ9CZT4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Polr3eQ9CZT4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Polr3eQ9CZT4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Polr3eQ9CZT4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Polr3eQ9CZT4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Polr3eQ9CZT4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Polr3eQ9CZT4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Polr3eQ9CZT4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Polr3eQ9CZT4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Polr3eQ9CZT4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Polr3eQ9CZT4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Polr3eQ9CZT4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Polr3eQ9CZT4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Polr3eQ9CZT4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Polr3eQ9CZT4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Polr3eQ9CZT4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Polr3eQ9CZT4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Polr3eQ9CZT4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Polr3eQ9CZT4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Polr3eQ9CZT4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Polr3eQ9CZT4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Polr3eQ9CZT4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Polr3eQ9CZT4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Polr3eQ9CZT4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Polr3eQ9CZT4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Polr3eQ9CZT4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Polr3eQ9CZT4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Polr3eQ9CZT4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Polr3eQ9CZT4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Polr3eQ9CZT4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Polr3eQ9CZT4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Polr3eQ9CZT4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Polr3eQ9CZT4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Polr3eQ9CZT4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Polr3eQ9CZT4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Polr3eQ9CZT4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Polr3eQ9CZT4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Polr3eQ9CZT4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Polr3eQ9CZT4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Polr3eQ9CZT4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Polr3eQ9CZT4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Polr3eQ9CZT4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Polr3eQ9CZT4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Polr3eQ9CZT4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Polr3eQ9CZT4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Polr3eQ9CZT4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Polr3eQ9CZT4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Polr3eQ9CZT4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Polr3eQ9CZT4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Polr3eQ9CZT4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Polr3eQ9CZT4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Polr3eQ9CZT4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Polr3eQ9CZT4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Polr3eQ9CZT4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Polr3eQ9CZT4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Polr3eQ9CZT4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Polr3eQ9CZT4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Polr3eQ9CZT4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Polr3eQ9CZT4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Polr3eQ9CZT4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Polr3eQ9CZT4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Polr3eQ9CZT4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Polr3eQ9CZT4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr3eQ9CZT4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr3eQ9CZT4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr3eQ9CZT4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Polr3eQ9CZT4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Polr3eQ9CZT4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Polr3eQ9CZT4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Polr3eQ9CZT4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Polr3eQ9CZT4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Polr3eQ9CZT4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Polr3eQ9CZT4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Polr3eQ9CZT4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Polr3eQ9CZT4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Polr3eQ9CZT4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Polr3eQ9CZT4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms