Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nde1Q9CZA6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nde1Q9CZA6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nde1Q9CZA6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nde1Q9CZA6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nde1Q9CZA6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nde1Q9CZA6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nde1Q9CZA6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nde1Q9CZA6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Nde1Q9CZA6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nde1Q9CZA6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nde1Q9CZA6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nde1Q9CZA6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nde1Q9CZA6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nde1Q9CZA6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nde1Q9CZA6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nde1Q9CZA6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Nde1Q9CZA6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nde1Q9CZA6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nde1Q9CZA6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nde1Q9CZA6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nde1Q9CZA6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nde1Q9CZA6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nde1Q9CZA6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nde1Q9CZA6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nde1Q9CZA6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nde1Q9CZA6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nde1Q9CZA6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nde1Q9CZA6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nde1Q9CZA6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Nde1Q9CZA6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nde1Q9CZA6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nde1Q9CZA6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nde1Q9CZA6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nde1Q9CZA6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nde1Q9CZA6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nde1Q9CZA6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nde1Q9CZA6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nde1Q9CZA6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nde1Q9CZA6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nde1Q9CZA6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nde1Q9CZA6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nde1Q9CZA6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nde1Q9CZA6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nde1Q9CZA6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nde1Q9CZA6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nde1Q9CZA6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nde1Q9CZA6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nde1Q9CZA6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nde1Q9CZA6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nde1Q9CZA6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nde1Q9CZA6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nde1Q9CZA6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nde1Q9CZA6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nde1Q9CZA6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nde1Q9CZA6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nde1Q9CZA6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nde1Q9CZA6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nde1Q9CZA6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nde1Q9CZA6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nde1Q9CZA6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nde1Q9CZA6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nde1Q9CZA6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nde1Q9CZA6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nde1Q9CZA6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nde1Q9CZA6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nde1Q9CZA6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nde1Q9CZA6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nde1Q9CZA6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nde1Q9CZA6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nde1Q9CZA6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nde1Q9CZA6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nde1Q9CZA6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nde1Q9CZA6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nde1Q9CZA6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nde1Q9CZA6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nde1Q9CZA6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nde1Q9CZA6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nde1Q9CZA6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nde1Q9CZA6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nde1Q9CZA6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nde1Q9CZA6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nde1Q9CZA6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nde1Q9CZA6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nde1Q9CZA6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nde1Q9CZA6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nde1Q9CZA6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nde1Q9CZA6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nde1Q9CZA6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nde1Q9CZA6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nde1Q9CZA6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nde1Q9CZA6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nde1Q9CZA6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nde1Q9CZA6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nde1Q9CZA6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nde1Q9CZA6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nde1Q9CZA6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nde1Q9CZA6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nde1Q9CZA6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nde1Q9CZA6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms